BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶大片段)是一种经过改造的酶,它来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通过重组技术在大肠杆菌中表达并纯化获得。这种酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等温扩增反应中非常有用,如环介导的等温扩增(LAMP)和滚环扩增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些关键特点和应用:1.**等温扩增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很强的链置换能力,适用于多种等温扩增反应,这些反应通常在50-68°C之间进行,比较好反应温度为65°C。2.**快速测序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速测序,特别是对于高GC含量的DNA模板或微量(纳克量级)DNA模板的测序。3.**全基因组扩增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因组扩增(WGA),这是一种在不需要热循环仪的情况下扩增整个基因组DNA的技术。4.**高dUTP耐受性**:与BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在进行等温扩增时不具有将dUTP掺入合成的DNA链的能力,这使得它在某些应用中更具优势。E1通常被认为是泛素化过程中的限速步骤,因为它涉及到泛素的激起和ATP的水解。Recombinant Human FGF-23
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物学实验中都是常用的酶,但它们之间存在一些关键的不同点:1.**来源和热稳定性**:-**TaqDNA聚合酶**来源于嗜热菌Thermusaquaticus,具有很好的耐热性,能够承受PCR的热变性步骤。-**BstDNA聚合酶**来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillusstearothermophilus),同样具有较高的热稳定性,适用于等温扩增,如LAMP技术,无需PCR热循环。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但没有3'-5'外切酶活性。这意味着它在DNA合成过程中可以校正一些错误,但保真性相对较低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和强链置换活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。这使得它在等温扩增中更为有效,尤其是在需要高保真度和快速扩增的应用中。3.**应用领域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技术,适用于各种DNA片段的扩增,包括复杂模板和长片段的扩增。-**BstDNA聚合酶**特别适用于等温扩增技术,如LAMP,这些技术不需要温度循环,适用于快速、低成本的DNA扩增。4.**扩增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等温扩增中显示出比传统TaqDNA聚合酶更快的扩增速度和更高的产量,尤其是在优化的LAMP反应中。
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一种来自大肠杆菌的DNA损伤修复酶,具有以下特点:1.**双功能活性**:核酸内切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**释放受损嘧啶碱基**:N-糖基化酶活性可以释放双链DNA上受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一个脱嘌呤(apurinic,AP)位点。3.**切割AP位点**:AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。4.**识别并切除受损碱基**:核酸内切酶VIII可以识别并切除多种受损碱基,包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲。5.**与EndonucleaseIII的区别**:虽然核酸内切酶VIII与核酸内切酶III相似,但核酸内切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸内切酶III具有β裂解酶活性。6.**应用领域**:核酸内切酶VIII可以应用于单细胞凝胶电泳、NGS建库中DNA损伤修复、酶法合成DNA中释放DNA链、碱洗脱,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)进行含U片段的克隆等。
在PCR实验中,防止非特异性扩增的关键在于优化实验条件和采取一些特定的策略。以下是一些有效的方法:1.**优化引物设计**:引物设计是PCR成功的关键。应确保引物序列具有高度特异性,避免与非目标序列互补。使用在线工具进行引物设计,并进行BLAST搜索以确认特异性。2.**使用热启动PCR**:热启动PCR技术可以抑制室温下的DNA聚合酶活性,减少非特异性扩增。这种方法通过在高温下激起酶的活性,从而在PCR体系配制阶段降低引物与模板或引物与引物之间的非特异性结合。3.**调整Mg2+浓度**:Mg2+浓度对PCR扩增的特异性和产量有重要影响。过高的Mg2+浓度可能导致非特异性扩增,因此需要优化Mg2+浓度以获得比较好的结果。4.**退火温度优化**:退火温度对PCR特异性至关重要。较高的退火温度有助于减少非特异性结合,但过高的退火温度可能会降低引物与模板的结合效率。通常,退火温度设置比引物的Tm值低5°C左右。5.**使用降落PCR**:降落PCR(TouchdownPCR)通过在初始循环中使用较高的退火温度,然后逐渐降低退火温度,从而在PCR开始时减少非特异性扩增,同时在后续循环中保持特异性扩增。FnCas12a需要一个crRNA,而不需要tracrRNA,简化了RNA的设计和构建过程。
耐高盐全能核酸酶与一般核酸酶的主要区别体现在以下几个方面:1.**盐耐受性**:-**耐高盐全能核酸酶**:具有较高盐浓度耐受性,在150-900mM盐浓度范围内有效,尤其在600-700mM盐浓度下活性比较好。-**一般核酸酶**:大多数全能核酸酶在高盐环境下会失活,酶切效果降低。2.**活性条件**:-**耐高盐全能核酸酶**:在0.5MNaCl条件下具有比较好活性,这使得它在高盐环境下也能保持高效。-**一般核酸酶**:可能在低盐或无盐条件下活性更高,但在高盐条件下活性受限。3.**应用领域**:-**耐高盐全能核酸酶**:广泛应用于生产工艺流程中高盐环境下核酸污染去除,如病毒纯化、疫苗生产、蛋白和多糖类制药工业等。-**一般核酸酶**:可能更多用于一般的分子生物学实验,如DNA或RNA的降解,但不特别针对高盐环境。4.**酶切效果**:-**耐高盐全能核酸酶**:能够有效去除核酸残留,将所有类型的DNA和RNA降解为3~5个碱基片段。-**一般核酸酶**:酶切效果可能受到高盐环境的影响,导致效率降低。5.**pH范围**:-**耐高盐全能核酸酶**:具有宽泛的pH范围(7.0-11.0),在这一范围内保持活性。-**一般核酸酶**:可能具有更窄的pH活性范围。尽管Ultra-Long Master Mix设计用于长片段扩增,但在某些情况下,可能出现非特异性扩增,需要通过优化引物。SHU 9119
One Step RT-qPCR SYBR Green Kit 是一种用于实时荧光定量PCR的试剂盒,它结合了反转录和PCR扩增步骤。Recombinant Human FGF-23
确保Cre重组酶只作用于特定细胞,主要通过以下几种方式实现:1.**组织特异性启动子**:-利用组织特异性启动子控制Cre重组酶的表达,可以确保Cre酶只在特定组织或细胞中表达。这种方法通过将Cre基因置于特定细胞类型特有的启动子控制之下,实现对Cre酶表达的精确控制。2.**诱导型Cre重组酶系统**:-通过使用Cre-ERT(雌素受体突变体与Cre重组酶的融合蛋白),可以实现对Cre活性的时间控制。在无他莫昔芬诱导时,Cre-ERT与热激蛋白Hsp90结合,定位于细胞质中;当他莫昔芬给药诱导时,Hsp90脱离Cre-ERT,使Cre-ERT进入细胞核发挥基因重组的作用。这种系统相当于为Cre-Lox系统加装了一个由他莫昔芬控制的外源开关,使得体内基因编辑更具时空灵活性。3.**药物诱导的Cre系统**:-例如Tet-on系统,通过四环素或其衍生物多西环素的添加来激起基因表达。在三重转基因动物中,rtTA在特定启动子的控制下表达,多西环素与rtTA结合,Cre的表达,导致固定的报告基因重组。4.**AAV递送Cre**:-利用包含组织特异性启动子的腺相关病毒(AAV)载体可以选择性地将Cre重组酶递送至特定细胞。
Recombinant Human FGF-23
蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一种特殊的融合蛋白,它结合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些关键特点和应用:1.**融合表达产物**:pA-MNase是蛋白A与微球菌核酸酶MNase的融合表达产物,因此它同时具有ProteinA的抗体结合活性和MNase的核酸内切酶活性。2.**双重功能**:由于其双重功能,pA-MNase常用于蛋白质-DNA相互作用研究,特别是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsin...