Recombinant Rat Midkine

在基因编辑中，除了NLS-Cas9-EGFPNuclease，还有多种技术可以提高编辑的特异性，这些技术包括：1.**高保真Cas9变体**：通过工程化改造Cas9蛋白，例如使用SpCas9-HF1或eSpCas9等高保真变体，可以减少脱靶效应，提高特异性。2.**碱基编辑器（BaseEditors）**：这类编辑器可以在不产生DNA双链断裂的情况下直接在特定位置进行单个碱基的转换，从而减少非目标编辑。3.**引导编辑器（PrimeEditors）**：由哈佛大学刘如谦教授团队开发的引导编辑器可以在不依赖DNA双链断裂和同源定向修复的情况下，实现精细的基因组编辑。4.**CRISPRi和CRISPRa**：这两种技术分别用于抑制或激起特定基因的表达，而不切割DNA，从而减少了脱靶风险。5.**新型CRISPR系统**：例如CRISPR/Cas12j和CRISPR/CasΦ，这些系统可能具有不同的PAM序列要求和更高的特异性。6.**AI辅助设计**：利用人工智能预测和优化sgRNA的设计，以减少脱靶效应。7.**优化递送系统**：改进CRISPR组分的递送方法，例如使用核糖核的蛋白（RNP）复合物，可以提高编辑效率和特异性。8.转座子编辑系统：利用转座子进行基因组编辑，可以在不依赖DNA双链断裂的情况下实现大片段DNA序列的插入。

pA-Tn5转座酶是一种经过改造的高活性Tn5转座酶，与ProteinA融合，形成一种新型融合酶，应用于CUT&Tag技术中，用于研究蛋白质与基因组DNA的相互作用。这种融合酶具备以下特点：1.**高活性**：pA-Tn5转座酶是超高活性的突变形式，体外转座效率比野生型高1000倍。2.**ProteinA融合**：pA-Tn5转座酶的N端结构域为ProteinA的一部分，可以与免疫球蛋白的Fc区相互作用，特别是与大多数哺乳动物的IgG结合。3.**Tn5转座酶活性**：C端结构域为Tn5转座酶，能够特异性识别转座子两端反向重复的ME序列(MosaicEnd)，并在形成转座复合体后随机插入靶DNA中。4.**应用广**：适用于CUT&Tag技术、高通量测序建库、ATAC-seq等，特别适用于早期胚胎发育、干细胞、以及表观遗传学等研究领域。5.**操作简便**：pA-Tn5转座酶的使用简化了实验步骤，可以在一步反应中实现DNA片段化和接头连接，从细胞到二代测序文库的转化过程需9小时。6.**低细胞投入量**：CUT&Tag技术允许从低至60个细胞的样本中获得结果，甚至可以应用于单细胞水平的研究。7.**高质量结果**：pA-Tn5转座酶的使用可以保证DNA片段化，同时获得的蛋白纯度高、核酸残留低。Recombinant Human B7-H3(4Ig)/B7-H3b (hFc Tag)牛痘DNA拓扑异构酶I应储存在-20°C的环境中，这有助于保持其活性。在这种条件下，该酶可以保存长达3年。

pA-Tn5转座酶的高活性是其重要特性之一，这种高活性主要来源于以下几个方面：1.**转座酶突变体**：pA-Tn5转座酶是由Tn5转座酶的高活性突变体构成的。这种突变体相比野生型Tn5转座酶，在体外的转座效率显著提高，通常提升1000倍以上。2.**ProteinA融合**：pA-Tn5转座酶将ProteinA与高活性Tn5转座酶融合，这种融合不仅保留了Tn5转座酶的高效DNA切割能力，还通过ProteinA的抗体结合特性，提高了对特定DNA序列的靶向能力。3.**转座随机性**：pA-Tn5转座酶能够在整个基因组上实现随机的DNA切割，这为高通量测序提供了广的覆盖度。4.**稳定性**：高活性的pA-Tn5转座酶在各种实验条件下都能保持稳定，包括在不同的温度和pH值条件下。5.**插入位点易测序**：pA-Tn5转座酶产生的DNA片段具有明确的插入位点，这些位点容易被高通量测序技术识别和分析。6.**高效片段化**：在CUT&Tag等实验中，pA-Tn5转座酶能够高效地实现目标蛋白结合DNA的片段化，为后续的测序和分析打下基础。7.**低细胞投入量**：由于其高活性，pA-Tn5转座酶允许从极少量的细胞中进行实验，如单细胞水平的研究。

SpCas9蛋白（来自化脓性链球菌的Cas9蛋白）在基因编辑中的主要作用是作为核酸酶，能够精确地切割目标DNA序列。以下是SpCas9在基因编辑中的几个关键步骤和作用：1.**识别和结合**：SpCas9蛋白与一个单导向RNA（sgRNA）结合，形成RNP复合物。这个复合物能够识别并结合到基因组中与sgRNA互补的特定DNA序列。2.**PAM序列识别**：SpCas9需要一个称为原间隔子相邻基序（PAM）的特定序列作为识别目标DNA的先决条件。对于SpCas9，这个PAM序列通常是5'-NGG-3'。3.**DNA切割**：一旦RNP复合物与目标DNA结合，SpCas9就会在PAM序列的3个碱基对的上游位置切割DNA双链，产生一个双链断裂（DSB）。4.**引发DNA修复**：DNA双链断裂触发细胞的DNA修复机制，包括同源定向修复（HDR）和非同源末端连接（NHEJ）。研究人员可以利用这些修复机制来插入、删除或替换特定的DNA序列。5.**基因修改**：通过HDR，可以在断裂的DNA两端引入特定的DNA模板，从而实现精确的基因编辑。而NHEJ通常会导致小的插入或缺失（indel），这可以用来产生基因的敲除或敲入。6.**提高编辑效率**：为了提高SpCas9的编辑效率，研究人员可能会使用优化的sgRNA设计、蛋白质工程或嵌合融合蛋白等策略。

EndoH糖苷内切酶H（EndoH）在实验中通常用于分析以下类型的糖链：1.**高甘露糖型糖链**：EndoH能够特异性地识别并切割高甘露糖型N-连接糖链，这些糖链通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**某些杂合型糖链**：EndoH也能对某些杂合型寡聚糖的壳二糖结构进行切割，去除糖蛋白中的N-连接高甘露糖。3.**N-连接糖链**：EndoH主要用于去除糖蛋白中的N-连接高甘露糖，这有助于研究糖链结构和糖基化模式。4.**抗体糖型分析**：在IgG中，Fc区Asn297处的保守N-连接糖对其活性至关重要，EndoH可用于分析这些糖链。5.**糖蛋白的糖基化模式**：EndoH有助于分析糖蛋白的糖基化位点、糖基化程度以及糖链的具体结构。6.**糖链分析和结构表征**：在糖链分析的主要策略中，EndoH作为高效、准确、稳定的去糖基化方法，有助于从糖蛋白上游离糖链，然后进行详细的分析表征。EndoH的使用可以为研究者提供关于糖蛋白糖基化模式的重要信息，尤其是在抗体药物研究和开发中，对于理解糖链如何影响药物的活性、稳定性和免疫原性具有重要意义。

FnCas12a产品不含DNA内切酶和外切酶，也不含RNA酶，保证了实验的准确性和重复性。Recombinant Rat Midkine

EndoS糖苷内切酶在ADCs制备中的具体应用步骤，根据上海药物研究所的研究，可以概括为以下几个关键环节：1.**筛选糖底物和糖苷内切酶**：研究人员筛选了一系列糖底物和糖苷内切酶，发现Endo-S2酶能够将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点，且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响Endo-S2的转糖基化活性。2.**抗体糖基化改造**：利用Endo-S2和LacNAc的组合，直接实现野生型抗体的糖基化改造。Endo-S2对多样化LacNAc修饰的兼容性，可以高效获得功能修饰的糖工程抗体。3.**设计合成药物-连接子复合物**：研究人员设计并合成了LacNAc-linker-drug复合物结构，这是实现定点ADC化合物“一步”组装的关键。4.**“一步”定点偶联**：通过Endo-S2的催化作用，将小分子细胞毒药物通过特定的糖链结构直接定点连接到抗体的糖基化位点，简化了ADCs的制备流程。5.**评价和测试**：对获得的糖链定点ADC化合物进行结构均一性、亲水性、体外稳定性及体外活性的测试。测试结果显示，这些化合物具有非常好的结构均一性（DAR=2）、亲水性和体外稳定性，并且在体外具有强大的瘤抑制活性。