Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease)高度特异性地作用于5'端磷酸化的双链DNA主要通过以下几个方面实现:1.**结构特异性识别**:Lambda核酸外切酶具有识别特定DNA结构的能力,特别是5'端磷酸化的双链DNA。这种识别能力通常由酶的活性位点结构决定,能够与5'-磷酸基团形成特定的相互作用。2.**酶活性位点**:酶的活性位点含有氨基酸残基,这些残基能够与5'-磷酸基团形成氢键或其他非共价相互作用,从而稳定酶与DNA的结合。3.**切割机制**:Lambda核酸外切酶通过水解5'-磷酸二酯键来降解DNA链。它从5'端开始,逐个移除核苷酸,直到遇到非5'-磷酸化的末端或遇到结构上的障碍。4.**低活性对非特异性底物**:对于5'-羟基(OH)末端的DNA或单链DNA,Lambda核酸外切酶的活性降低,因为这些底物缺乏与酶活性位点结合所需的特异性相互作用。5.**酶动力学**:Lambda核酸外切酶对5'-磷酸化双链DNA的酶动力学参数(如Km和Vmax)与对非特异性底物的参数有差异,这反映了其对特异性底物的高亲和力和高催化效率。6.**过程性(Processivity)**:一旦Lambda核酸外切酶结合到特异性底物上,它可以连续移除多个核苷酸,而不需要频繁地与底物解离和重新结合,这增加了酶的效率。利用His标签通过亲和层析从细胞裂解物中纯化目标蛋白,然后可能通过离子交换层析、等方法进一步提纯。Recombinant Mouse CD83 Protein,hFc Tag
5'DNA腺苷酰化试剂盒中使用的酶通常被称为腺苷酰化酶(Adenylase),这种酶能够催化5'端磷酸化的单链DNA或RNA(pDNA或pRNA)转换成5'端腺苷酰化DNA或RNA(AppDNA或AppRNA)。根据搜索结果,该酶的来源是嗜热古细菌,在大肠杆菌中进行表达并纯化而获得。这种酶在反应中将ATP分解成AMP和PPi,然后将AMP转移到单链DNA的5'磷酸基团上,形成腺苷酰化单链DNA,从而制备出腺苷酰化接头(linker)。此外,一些5'DNA腺苷酰化试剂盒中使用的酶是MthRNA连接酶(例如NEB#M2611A),这种酶也用于生成高产量的5'腺苷酰化DNA,并且操作简便,具有超过95%的效率,无需凝胶纯化即可完成单步反应。MthRNA连接酶是一种已知能够在65℃下有效工作的酶,有助于避免DNA的二级结构对腺苷酰化反应的干扰。这些酶的高效率和特异性使得5'DNA腺苷酰化试剂盒在单链DNA的5'端腺苷酰化修饰中非常有效,常用于miRNA等3'端为羟基的RNA或单链DNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等应用中。Recombinant Cynomolgus S100A9/MRP14 Protein,His Tag在50 μL的反应体系中,建议使用1.5 μL的5× PCR Enhancer(如果需要)和0.5 μL的Phusion DNA Polymerase。
Lambda核酸外切酶的生产和应用涉及到多种生物技术和分子生物学技术,主要包括:1.**基因克隆(GeneCloning)**:首先将Lambda核酸外切酶的基因从噬菌体λ的基因组中克隆出来,并插入到质粒或其他载体中。2.**转化(Transformation)**:将含有Lambda核酸外切酶基因的质粒转化到宿主细胞,通常是大肠杆菌(E.coli),以便于在这些细胞中表达Lambda核酸外切酶。3.**表达系统(ExpressionSystems)**:利用原核或真核表达系统在宿主细胞中表达Lambda核酸外切酶的蛋白。4.**蛋白质纯化(ProteinPurification)**:使用各种色谱技术,如亲和层析、离子交换层析、凝胶过滤层析等,从宿主细胞的裂解物中分离和纯化Lambda核酸外切酶。5.**PerfectProtein™技术平台**:这是一种专有技术,用于生产高质量的重组蛋白,包括Lambda核酸外切酶。6.**热失活(HeatInactivation)**:在某些应用中,可能需要通过热处理来失活Lambda核酸外切酶,以终止其催化活性。7.**荧光共振能量转移(FluorescenceResonanceEnergyTransfer,FRET)**:这是一种用于实时监测酶活性和动力学的技术,可用于研究Lambda核酸外切酶降解核酸的机制。
在5'DNA腺苷酰化试剂盒中,"5'"表示DNA分子的5'端,即DNA链的起始端。DNA和RNA分子由核苷酸单元组成,每个核苷酸由一个糖分子、一个磷酸基团和一个含氮碱基组成。在DNA中,糖分子是脱氧核糖。这些核苷酸通过磷酸二酯键连接在一起形成多核苷酸链。DNA链有两个端点,分别是5'端和3'端,这两个端点是根据糖分子上碳原子的编号来命名的:-**5'端**(5'-phosphategroup):这个端点的磷酸基团连接在脱氧核糖的第五个碳原子上。-**3'端**(3'-hydroxylgroup):这个端点的脱氧核糖上第三碳原子上有一个自由的羟基(-OH)。5'DNA腺苷酰化试剂盒的目的是将腺苷酸(AMP)加到DNA分子的5'端,形成5'-磷酸腺苷键。这种修饰对于某些分子生物学应用非常重要,例如在RNA干扰(RNAi)、高通量测序、连接反应或PCR检测中制备特定的接头或适配体。在5'DNA腺苷酰化试剂盒中,通常包含一种酶(如腺苷酸化酶或某些RNA连接酶),它可以催化将ATP中的AMP部分转移到DNA的5'端磷酸基团上,从而完成腺苷酰化过程。TBE (Thymine base editor):这是一种新型的碱基编辑工具,不依赖脱氨酶,能够通过人源化尿嘧啶DNA-糖基化酶。
PCR产物直接进行电泳分析通常涉及以下步骤:PCR扩增:首先使用PCR Master Mix和特定的引物对目标DNA片段进行扩增。PCR产物的准备:如果使用的是含有预混凝胶加载染料的PCR Master Mix(如某些Blood Direct PCR Master Mix),则PCR产物在扩增后已经含有了适合电泳的染料。如果没有使用含染料的Master Mix,则需要在PCR反应完成后向产物中添加适量的凝胶加载染料。电泳槽的准备:清洁电泳槽,确保没有灰尘或残留物。安装电泳板和梳子,注意密封以防缓冲液泄漏。灌注缓冲液:向电泳槽中灌注适量的电泳缓冲液,常用的缓冲液有1X TAE或1X TBE。PCR产物的加载:将PCR产物轻轻混合均匀,避免气泡的产生。使用移液枪或微量移液管将PCR产物加入到凝胶孔中。如果PCR Master Mix中已含有染料,通常不需要额外添加。电泳条件的设置:根据PCR产物的大小和凝胶的浓度选择合适的电压和时间进行电泳。例如,较小的DNA片段可能需要较高的电压,而较大的片段则可能需要较低的电压和更长的时间。FnCas12a不仅可用于体外dsDNA的特异剪切,也可用于靶标核酸的快速检测,如HOLMES核酸快检技术。Recombinant Human FcRn Protein,His Tag
在目标蛋白的C末端添加His标签和Avi标签。有助于通过亲和层析进行蛋白纯化,而Avi标签则可以用于生物素。Recombinant Mouse CD83 Protein,hFc Tag
DNaseI是一种使用的酶,它能够水解单链或双链DNA,产生5'端为磷酸基团的二核苷酸、三核苷酸或更短的寡核苷酸片段。这种酶的活性依赖于钙离子,并且可以被镁离子或二价锰离子启动。在镁离子存在的情况下,DNaseI可以随机剪切双链DNA的任意位点;而在二价锰离子存在时,它可以在同一位点剪切DNA双链,形成平末端或1-2个核苷酸突出的粘末端。DNaseI的一个特点是它不含RNase活性,因此可以用于处理各种RNA样品,而不会对RNA造成降解。DNaseI的应用非常广,包括但不限于:-制备不含DNA的RNA样品;-在RT-PCR反应前去除RNA样品中可能的DNA污染;-体外RNA聚合酶催化的RNA转录后去除DNA模板;-进行DNaseI足迹实验研究DNA-蛋白质相互作用;-缺口平移(nicktranslation);-产生DNA随机片段文库;-在细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。DNaseI通常从牛胰腺中纯化得到,其分子量约为32kDa(单体)。活性定义为在37℃、10分钟内,能够完全降解1μgpBR322质粒DNA所需的酶量。在实验中,DNaseI的活性单位通常以Kunitz单位来表示,该单位是基于特定条件下酶降解DNA的能力来定义的。Recombinant Mouse CD83 Protein,hFc Tag
磁珠法在基因克隆中的应用主要体现在以下几个方面:1.**质粒DNA的提取**:磁珠法可以用于从细菌细胞中提取质粒DNA,这对于质粒的克隆和表达至关重要。通过磁珠法提取的质粒DNA纯度高,适合用于后续的酶切、连接、转化等分子克隆步骤。2.**基因组DNA的提取**:磁珠法可以用于从各种生物样本中提取基因组DNA,这对于基因组的克隆和分析非常重要。提取的基因组DNA可以用于PCR扩增、基因表达分析、基因突变检测等。3.**mRNA的提取和纯化**:在mRNA克隆中,磁珠法可以用于提取和纯化mRNA,这对于cDNA的合成和基因表达分析非常关键。磁珠法提取的mRNA纯度高,可以用于后续的cDNA合成和...