3C-like蛋白酶是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)等其它冠状病毒的繁殖过程中极为重要的蛋白酶。它已成为人类在抗冠状病毒领域中的研究热点。本文基于计算生物学方法对与MERS-CoV同属的蝙蝠冠状病毒HKU4(HKU4-CoV)的43个肽类3C-like蛋白酶抑制剂分子,建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。在基于配体叠合的基础上,发现比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)中的四个场组合(位阻场、静电场、氢键供体场与氢键受体场)为比较好的模型(Q2=0.522,Rncv2=0.996,Rpre2=0.904;Q2:交叉验证相关系数,Rncv2:非交叉验证相关系数,Rpre2:验证集分子的预测值相关系数),并借助该模型通过分子对接(docking)与分子动力学(MD)方法阐明了配受体结合作用。实验结果表明:(1)基于比较好的CoMSIA模型基础上的三维等势图形象地说明了分子基团的位阻作用、静电作用、氢键供体与氢键受体作用对分子生物活性的影响;(2)分子对接研究结果显示了疏水性以及结晶水、氨基酸His166和Glu169在配体和受体结合过程中产生重要作用;人α-凝血酶,一种丝氨酸蛋白酶,是凝血级联反应中的中心酶,对止血和其他多种生理过程至关重要。Recombinant Mouse EGFR/HER1 Protein,His Tag
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)中的逆转录酶(ReverseTranscriptase,RT)具有一个关键特性:它们通过特定的突变消除了RNaseH活性。RNaseH是一种通常与某些逆转录酶相关的酶活性,它能够降解RNA。然而,在1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)中,逆转录酶被设计成不具有这种降解RNA的能力,从而在合成cDNA的链时保护RNA模板不被降解。以下是1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)中逆转录过程的一般步骤,以及如何避免RNA降解:1.**RNA模板准备**:首先确保RNA模板的纯度和完整性,避免DNA污染。可以通过DNaseI处理去除RNA样品中的DNA污染。2.**混合反应组分**:将RNA模板、dNTPs(去氧核苷酸三磷酸)、逆转录引物(如oligo(dT)或随机引物)和缓冲液混合。3.**逆转录酶添加**:加入经过突变处理的逆转录酶,这种酶缺乏RNaseH活性,因此不会在合成过程中降解RNA。4.**逆转录反应**:在适宜的温度下进行逆转录反应,逆转录酶根据RNA模板合成cDNA链。5.**终止反应**:通过加热至一定温度来终止逆转录反应。Recombinant Human Bcl-w泛素蛋白(Ubiquitin,简称Ub)是一种在真核细胞中普遍存在的小分子蛋白,具有高度保守性。
BloodDirectPCRMasterMix(2×)适合血液样本的PCR扩增主要通过以下几个方面:1.**抗血液抑制剂能力**:该预混合溶液含有的DNA聚合酶和其他成分能够抵抗血液样本中的PCR抑制剂,如胆酸盐、血红素、蛋白质等。2.**优化的缓冲体系**:预混合溶液中的缓冲体系经过特别优化,以适应血液样本中的特定条件,包括pH、离子强度和Mg2+浓度,从而提高PCR扩增的效率和特异性。3.**高保真DNA聚合酶**:包含的DNA聚合酶具有高保真度,能够在复制DNA时减少错误,保证扩增结果的准确性。4.**快速扩增速度**:一些BloodDirectPCRMasterMix产品具有快速扩增的特点,可以缩短PCR实验的时间。5.**宽泛的GC含量适应性**:该产品可以用于扩增不同GC含量的基因,包括高GC和低GC区域,提高了PCR的适用性。6.**直接使用血液样本**:无需对血液样本进行DNA提取或纯化,可以直接将抗凝血样品或干血斑样品加入PCR反应中。7.**兼容性**:兼容多种抗凝剂,如EDTA、肝素或柠檬酸钠,适用于不同来源的血液样本。8.**简化的操作流程**:由于省去了DNA提取的步骤,BloodDirectPCRMasterMix简化了实验操作流程,减少了实验时间和潜在的污染风险。
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease)高度特异性地作用于5'端磷酸化的双链DNA主要通过以下几个方面实现:1.**结构特异性识别**:Lambda核酸外切酶具有识别特定DNA结构的能力,特别是5'端磷酸化的双链DNA。这种识别能力通常由酶的活性位点结构决定,能够与5'-磷酸基团形成特定的相互作用。2.**酶活性位点**:酶的活性位点含有氨基酸残基,这些残基能够与5'-磷酸基团形成氢键或其他非共价相互作用,从而稳定酶与DNA的结合。3.**切割机制**:Lambda核酸外切酶通过水解5'-磷酸二酯键来降解DNA链。它从5'端开始,逐个移除核苷酸,直到遇到非5'-磷酸化的末端或遇到结构上的障碍。4.**低活性对非特异性底物**:对于5'-羟基(OH)末端的DNA或单链DNA,Lambda核酸外切酶的活性降低,因为这些底物缺乏与酶活性位点结合所需的特异性相互作用。5.**酶动力学**:Lambda核酸外切酶对5'-磷酸化双链DNA的酶动力学参数(如Km和Vmax)与对非特异性底物的参数有差异,这反映了其对特异性底物的高亲和力和高催化效率。6.**过程性(Processivity)**:一旦Lambda核酸外切酶结合到特异性底物上,它可以连续移除多个核苷酸,而不需要频繁地与底物解离和重新结合,这增加了酶的效率。肠激酶能够特异性识别并切割含有Aspartate-Aspartate-Aspartate-Lysine (DDDK) 序列的蛋白质。
AdvanceFastPCRMasterMix(2×)中的特异性主要体现在以下几个方面:1.**高保真DNA聚合酶**:该产品含有的HieffCanace™AdvanceFastHigh-FidelityDNAPolymerase是一种高保真度的DNA聚合酶,它具有较低的错误率,能够在复制DNA时减少突变的发生,特别是在高GC含量的基因区域。2.**优化的缓冲体系**:产品中的缓冲体系经过特别优化,能够提供适宜的反应条件,从而提高PCR反应的特异性,减少非特异性扩增。3.**快速扩增速度**:该产品具有快速扩增的特点,速度可达5秒/kb,快速的扩增速度有助于减少非特异性扩增的机会。4.**宽泛的GC含量适应性**:它可以用于扩增20-80%GC含量的基因,这表明它对不同基因序列的适应性强,有助于提高特异性扩增。5.**良好的稳定性**:产品含有特异保护剂,即使在反复冻融后仍能保持稳定活性,这有助于维持PCR反应的一致性和特异性。6.**直接电泳**:由于含有预添加的电泳指示剂,PCR产物可以直接进行电泳分析,减少了后续操作步骤中可能引入的非特异性问题。高亲和力和选择性A2AR抑制剂的开发:研究者正在开发新型的A2AR小分子拮抗剂,以提高药物的疗效和选择性。HSV-gB2 (498-505)
α-凝血酶是研究血液凝固机制和血栓性疾病发展的主要靶点。重组α-凝血酶用于体外测定。Recombinant Mouse EGFR/HER1 Protein,His Tag
Lambda核酸外切酶的活性表现在其高度特异性和过程性地消化5'端磷酸化的双链DNA。以下是一些关键点,描述了Lambda核酸外切酶的活性特征:1.**高度过程性(HighlyProcessive)**:Lambda核酸外切酶是一种高度过程性的5'→3'外切酶,这意味着它能够连续消化多个核苷酸,而不需要在每一步之后重新结合底物。2.**底物特异性(SubstrateSpecificity)**:该酶选择性地消化5'端磷酸化的双链DNA链,对单链DNA和非磷酸化DNA表现出低活性。3.**活性定义(ActivityDefinition)**:一个活性单位定义为在37°C下,30分钟内在50μl反应体积中,使用1XLambdaExonucleaseReactionBuffer和1μg声波破碎的双链[3H]-DNA底物,产生10nmol酸溶性脱氧核苷酸所需的酶量。4.**反应条件(ReactionConditions)**:通常在37°C下进行孵育,使用1XLambdaExonucleaseReactionBuffer,该缓冲液包含67mMGlycine-KOH,2.5mMMgCl2,50µg/mlBSA,pH值为9.4。5.**热失活(HeatInactivation)**:通过在75°C下加热10分钟可以使Lambda核酸外切酶失活。6.**特定活性(SpecificActivity)**:Lambda核酸外切酶的特定活性为50,000单位/毫克蛋白。
磁珠法在基因克隆中的应用主要体现在以下几个方面:1.**质粒DNA的提取**:磁珠法可以用于从细菌细胞中提取质粒DNA,这对于质粒的克隆和表达至关重要。通过磁珠法提取的质粒DNA纯度高,适合用于后续的酶切、连接、转化等分子克隆步骤。2.**基因组DNA的提取**:磁珠法可以用于从各种生物样本中提取基因组DNA,这对于基因组的克隆和分析非常重要。提取的基因组DNA可以用于PCR扩增、基因表达分析、基因突变检测等。3.**mRNA的提取和纯化**:在mRNA克隆中,磁珠法可以用于提取和纯化mRNA,这对于cDNA的合成和基因表达分析非常关键。磁珠法提取的mRNA纯度高,可以用于后续的cDNA合成和...