金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus,S.aureus)也称“金葡菌”,隶属于葡萄球菌属,是革兰氏阳性菌表示,为一种常见的食源性致病微生物。该菌较适宜生长温度为37℃,pH为7.4,耐高盐,可在盐浓度接近10%的环境中生长。金黄色葡萄球菌常寄生于人和动物的皮肤、鼻腔、咽喉、肠胃、痈、化脓疮口中,空气、污水等环境中也无处不在。金黄色葡萄球菌形态为球形,在培养基中菌落特征表现为圆形,菌落表面光滑,颜色为无色或者金黄色,无扩展生长特点,将金黄色葡萄球菌培养在哥伦比亚血平板中,在光下观察菌落会发现周围产生了透明的溶血圈。金黄色葡萄球菌在显微镜下排列成葡萄串状,金黄色葡萄球菌无芽孢、鞭毛,大多数无荚膜。是常见的引起食物中毒的致病菌。常见于皮肤表面及上呼吸道黏膜。金黄色葡萄球在自然界中无处不在,空气、水、灰尘及人和动物的排泄物中都可找到。禾赤镰孢菌种
在裂殖过程中,枯草芽孢杆菌还会分泌枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质,以杀死并抑制其它微生物的定殖。由于不同的枯草菌株表现的抑菌活性和生物活性有很大差别,在实际使用中的防病、促生长效果也会有很大差距。细菌没有孢子,这里指的是芽孢。芽孢是细菌个体在条件不适宜的时候形成的一个休眠个体,以保护个体在不良环境中存活下来。CFU是指检测细菌时,将菌液稀释到一定倍数后,在平板上肉眼能看到的单个细菌个体所产生的菌落数目。说白了,10亿孢子活化之后一定是10亿CFU,而10亿CFU却说明不了它来自10亿孢子,有可能是刚开始1亿个芽孢裂殖几代后的结果。芽孢可以保存菌体刚开始的活性,而细菌菌体裂殖的后代,活性会逐代衰退。这也就是说再好的枯草菌剂也有一定的持效期,想要获得持续的防治效果,就必须持续的施用生物菌剂。禾赤镰孢菌种在铜绿假单胞菌培养基上呈蓝绿色或者红褐色菌落,365nm紫外灯下显荧光。
大肠杆菌属的系统发育:大量属于该物种的菌株已得到分离和鉴定。除了血清型(videsupra),它们还可以根据它们的系统发育(即推断的进化史)进行分类。如下所示,其中该物种分为六组。特别是全基因组序列的使用产生了高度支持的系统发育。基于这些数据,大肠杆菌的5个亚种被区分开来。系统发育距离(“关联性”)和病理学之间的联系很小,例如O157:H7血清型菌株形成一个分支(“一个独特的群”)—下面的E群——都是肠出血性菌株(EHEC),但并不是所有的EHEC菌株都是密切相关的。事实上,四种不同的志贺氏菌嵌套在大肠杆菌菌株(见上),然而E.albertii和E.fergusonii不属于这个群体。事实上,在包括类型菌株在内的系统基因组研究中,所有志贺菌都被放在大肠杆菌的一个亚种内,因此很难进行相应的重新分类。所有常用的研究菌株大肠杆菌属于a组,主要来源于Clifton的K-12菌株(λ⁺f⁺。O16)并且在较小程度上来自d'Herelle的大肠杆菌菌株(B菌株)(O7)。
菌株是物种中的一个亚组,它具有区别于其他菌株的独特特征。这些差异通常只能在分子水平上检测到。然而,它们可能导致细菌生理或生命周期的改变。例如,菌株可能获得致病能力、使用独特碳源的能力、占据特定生态位的能力或抗微生物剂的能力。不同品种的大肠杆菌通常是宿主特异性的,这使得确定环境样品中粪便污染的来源成为可能。例如,知道哪个大肠杆菌水样中存在的菌株使得研究人员可以假设污染是源于人类、另一种哺乳动物还是鸟类。枯草芽孢杆菌是微生物中可100%直达大小肠的活菌。
目前已知的大肠杆菌和志贺氏菌的完整基因组序列有三百多个。2014年之前,大肠杆菌类型菌株的基因组序列被添加到这个集中中。这些序列的比较显示出明显的多样性。每个基因组中只有大约20%的表示序列存在于每个分离株中,而每个基因组中大约80%在分离株之间有所不同。每个基因组包含4,000到5,500个基因,但是在所有已测序的大肠杆菌菌株(泛基因组)中,不同基因的总数超过16000个。这种非常多的组成基因被解释为三分之二的大肠杆菌泛基因组起源于其他物种,并通过水平基因转移过程到达。枯草芽孢杆菌有着很好的竞争作用,保护作物根部不受病菌侵染和抑制作物体内病原菌扩散。沉积物印度洋芽胞杆菌菌株
铜绿假单胞菌在普通琼脂培养基上生长18~24h可以见到扁平、湿润的菌落。禾赤镰孢菌种
SHBCCD73706库尔勒糖芽孢杆菌SHBCCD73706=JCM14865=KCTC13182Saccharibacilluskuerlensis模式菌株SHBCCD73707安徽黄杆菌SHBCCD73707=KCTC22128Flavobacteriumanhuiense模式菌株SHBCCD73708刺目黄假单胞菌SHBCCD73708Pseudomonasduriflava模式菌株SHBCCD73709泗阳鞘氨醇杆菌SHBCCD73709=KCTC22131Sphingobacteriumsiyangense模式菌株SHBCCD73710盐土假芽孢杆菌SHBCCD73710=KCTC13181Fictibacillussolisalsi模式菌株SHBCCD73711嗜线虫沙雷氏菌SHBCCD73711=KCTC22130Serratianematodiphila模式菌株SHBCCD73712沙漠棒杆菌SHBCCD73712Corynebacteriumdeserti产谷氨酸SHBCCD73713仙河深海螺旋菌SHBCCD73713=JCM14850Thalassospiraxianhensis模式菌株SHBCCD73714仙河盐单胞菌SHBCCD73714=JCM14849Halomonasxianhensis模式菌株SHBCCD73715天格尔黄杆菌SHBCCD73715=JCM15087Flavobacteriumtiangeerense模式菌株SHBCCD73716冰川游动微菌SHBCCD73716=JCM15088Planomicrobiumglaciei模式菌株SHBCCD73717鲑色沉积物杆状菌SHBCCD73717=NBRC103935Sediminibacteriumsalmoneum模式菌株SHBCCD73718陈文新氏黄杆菌SHBCCD73718=NBRC103934Flavobacteriumcheniae模式菌株 禾赤镰孢菌种
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