大肠杆菌属的系统发育:大量属于该物种的菌株已得到分离和鉴定。除了血清型(videsupra),它们还可以根据它们的系统发育(即推断的进化史)进行分类。如下所示,其中该物种分为六组。特别是全基因组序列的使用产生了高度支持的系统发育。基于这些数据,大肠杆菌的5个亚种被区分开来。系统发育距离(“关联性”)和病理学之间的联系很小,例如O157:H7血清型菌株形成一个分支(“一个独特的群”)—下面的E群——都是肠出血性菌株(EHEC),但并不是所有的EHEC菌株都是密切相关的。事实上,四种不同的志贺氏菌嵌套在大肠杆菌菌株(见上),然而E.albertii和E.fergusonii不属于这个群体。事实上,在包括类型菌株在内的系统基因组研究中,所有志贺菌都被放在大肠杆菌的一个亚种内,因此很难进行相应的重新分类。所有常用的研究菌株大肠杆菌属于a组,主要来源于Clifton的K-12菌株(λ⁺f⁺。O16)并且在较小程度上来自d'Herelle的大肠杆菌菌株(B菌株)(O7)。枯草芽孢杆菌能够很好的分解池中残饵、粪便、有机物等,具有很强的清理水中垃圾小颗粒的作用。嗜酸乳杆菌 SDC 20122013菌种
大肠杆菌是该属的模式种(埃希菌属),而埃希菌又是肠杆菌科的模式属,其类名并非源于肠杆菌属+“i”(sic、)+“aceae”,而是源于“肠杆菌”+“aceae”(肠杆菌不是属,而是源于肠内细菌的别称)。埃切里奇(Escherich)描述的原始菌株被认为已经丢失了,因此选择了一个新的类型菌株(新类型)作为表示:新类型菌株为U5/41T,也称为存储名称DSM30083,ATCC11775,和NCTC9001,其对鸡具有致病性并具有O1:K1:H7血清型。[39]然而,在大多数研究中,O157:H7、K-12MG1655或K-12W3110被用作表示大肠杆菌。该类型菌株的基因组直到至近才被测序。匍枝根霉黑根霉菌种大肠杆菌是短杆菌,两端呈钝圆形,革兰阴性。
SHBCCD73753副短短芽孢杆菌SHBCCD73753Brevibacillusparabrevis污水处理SHBCCD73754屎肠球菌SHBCCD73754Enterococcusfaecium饲料SHBCCD73755浸麻类芽孢杆菌SHBCCD73755Paenibacillusmacerans**乙醇菌SHBCCD73756栖植物潘隆尼亚碱湖杆菌SHBCCD73756Pannonibacterphragmitetus水处理SHBCCD73757甜菜假单胞菌SHBCCD73757Pseudomonasbeteli水处理SHBCCD73758谷粒副极小单胞菌SHBCCD73758Parapusillimonasgranuli水处理SHBCCD73759栖植物潘隆尼亚碱湖杆菌SHBCCD73759Pannonibacterphragmitetus水处理SHBCCD73760二氯甲烷屈曲杆菌SHBCCD73760Ancylobacterdichloromethanicus水处理SHBCCD73761嗜酸寡养单胞菌SHBCCD73761Stenotrophomonasacidaminiphila水处理SHBCCD73762氯酚假节杆菌SHBCCD73762PseudarthrobacterchlorophenolicusSHBCCD73763麦芽香肉杆菌SHBCCD73763CarnobacteriummaltaromaticumSHBCCD73764新疆黄杆菌SHBCCD73764FlavobacteriumxinjiangenseSHBCCD73765中华耐冷黄杆菌SHBCCD73765FlavobacteriumsinopsychrotoleransSHBCCD73766褪色沙雷氏菌(粘质沙雷氏菌)SHBCCD73766Serratiamarcescens2-酮基-L-古龙酸SHBCCD73767广食黄杆菌
大肠杆菌的耐药可以是天然固有的,也可以通过后天的基因突变、基因转移获得。固有耐药性(intrinsicresistance),即耐药性的产生并不依赖于抑菌药物的存在,而是细菌细胞所固有的,与细菌的遗传和进化密切相关。固有耐药性包括自发基因突变导致的耐药性和细胞膜药物外输作用引起的耐药性。获得性耐药(acquiredresis—tance)是指细菌在抑菌药物选择性压力存在下经过基因突变,或细菌在生长过程中由于移动耐药因子的转移而获得的一种表型。主要包括移动因子和抑菌药压力作用下引起基因突变所导致的耐药性。就目前的研究现状来看,大肠杆菌的耐药性机制主要有5种:①抗s素作用位点的改变或新作用位点的产生。②酶对抗s素的修饰和破坏。③增加抗s素从大肠杆菌向细胞外的主动排出作用。④细菌外膜通透性的改变。⑤质粒介导的耐药性。一种耐药机制可以对多种抗s素表现为抗性,同一种抗s素也常常出现多种耐药性机制共同抑制的现象。金黄色葡萄球分布于自然界,如空气、水、土壤、饲料和一些物品上。
金葡菌是导致医院和社区严重传染的常见病原体之一,能够引起不同程度的疾病,从轻微的皮肤或黏膜传染到甚至危及生命的脓毒血症、败血症或肺炎等。它已成为全球重症监护病房(ICU)、创伤等传染率较高的病原菌,也是常见的耐药菌之一。耐甲氧西林金葡菌(MRSA)的出现对公共卫生安全带来威胁。值得注意的是,此前传染过金葡菌并不足以建立保护性免疫并预防随后的传染,这种情况在复发性皮肤和软组织传染中尤为明显。金葡菌传染后宿主不能建立起保护性免疫,相关机制尚不明确,这导致对其疫苗的研发较缓慢。金黄色葡萄球对大部分维生素的抗性得到了提高。粪链球菌菌种
枯草芽孢杆菌能够促使土壤中的有机质分解成腐殖质,刺激作物生长。嗜酸乳杆菌 SDC 20122013菌种
枯草芽孢杆菌分泌的多种胞外酶,已应用到许多不同领域中。脂肪酶具有多种催化能力,其在动物或人体的消化道中与原本存在的消化酶类共同发挥作用,使消化道处于健康的平衡状态。枯草芽孢杆菌还未直接用于食品中,但有研究表明枯草芽孢杆菌在酿酒过程中起到了非常重要的作用。芽孢杆菌,包括嗜热芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及地衣芽孢杆菌等都有较强的水解淀粉和蛋白质的能力,是酱香型白酒的风味物生成和风格形成的重要菌类。由于芽孢杆菌能够产生蛋白酶与淀粉酶,其水解原料形成丰富的前体环境,有利于风味物质的生成。嗜酸乳杆菌 SDC 20122013菌种
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