经典Trizol法并不能获得总RNA:这个事实可能会刷不少新手甚至老手的三观,但确有实验支持:经典Trizol法会选择性丢失低GC比的miRNA。这一点,源自一则作者自撤稿的故事。V. Narry Kim是韩国鼎鼎大名的美女科学家,专做RNA相关的研究,包括miRNA。几年前她们组发现一个奇怪的“现象”,即贴壁细胞在消化之后,会有一些miRNA的丰度突然降低,看起来好像是被快速“降解”掉了,并据此写了一篇文章发到Molecular Cell上。但很快她们就发现,这个“现象”难以重复:如果用Trizol做实验,就一定是阳性结果,而用试剂盒提RNA,就重复不出来。难道是号称能提总RNA的Trizol方案出了问题?确实如此。经进一步实验后发现,经典的Trizol方案会使得低GC比的miRNA丢失。在提取时,实验人员需要佩戴口罩和手套等各种防护装备,以防实验室污染。南昌正规RNA提取试剂单价
RNA提取真正需要注意的要点:你的植物组织样本采样、保存正常吗?组织裂解充分了吗?组织起始量是否过大?起始量过大的话,他们得带进去多少RNase呀,导致裂解液不能充分压制内源性的RNase,失败就在预料之中!你的细胞活性好吗?细胞都到衰亡期了,你提什么RNA呀;细胞加的那么多,破壁不充分,怎么裂解的好呢,他们本身得带进去多少内源性RNase污染呀!转移液体时吸到沉淀了吗?吸水相时碰到中间层了吗?乙醇干燥净了吗?裂解样本的过程是重中之重液氮研磨(手工):要先加液氮预冷一下研钵,然后研磨,研磨过程要保证研钵中一直有少量液氮,研磨完成一个样本后,直接加入裂解液涡旋震荡后放常温,或者直接丢到液氮中,全部研磨后一起加裂解液。液氮研磨(研磨仪):研磨模块丢到液氮中预冷,直到没有气泡冒出视为预冷完毕。在2ml圆底离心管(不需要无酶管,液氮研磨中不破裂就好)中加入5mm钢珠一粒,放进样品,投入液氮中预冷。把所有预冷好的离心管**研磨模块中,放进研磨机震荡20-30秒。完成后马上加裂解液,涡旋。合肥正规RNA提取试剂厂家供应在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成分。
piRNA。是一类长度约为24-31nt的非编码小RNA,通过特异性地与PIWI蛋白结合而发挥生物学作用。现已发现其在生殖干细胞分化、胚胎发育、维持基因组完整性、表达遗传学调控、异染色质的形成和物种的性别决定等方面起着重要作用,此外在压制转座子转录和基因转录后调控中也扮演着重要角色,并且越来越多的研究表明在病症组织中piRNA的表达不尽相同。lncRNA。长度约为200-100000个核苷酸,可以通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达,参与疾病相关的信号通路,对疾病的发生、发展及医治有重要作用。研究发现,lncRNA-DANCR明显增强肝病细胞的感性特征,促进一些疾病细胞的形成,在体内干扰DANCR的作用可导致一些疾病细胞活力降低,同时阻止一些miRNA的压制效应,揭发出一个涉及lncRNA、mRNA和miRNA的新一些疾病形成机制。可见,lncRNA对一些疾病方面有重要作用。另外有研究发现lncRNA在宿主抗病菌反应、骨关节炎、囊性纤维化、药物研发等方面也有重要的临床应用价值。
mRNA:是蛋白质合成(翻译)过程中的模版,蛋白质分子中氨基酸的排列顺序,就是由mRNA上每3个相邻的核苷酸形成的密码子的排列顺序决定的;tRNA:的作用是在蛋白质的合成过程中转运氨基酸,为蛋白质的合成提供原料;并可准确识别其所转运的氨基酸在mRNA上的密码子;rRNA:主要是和一些蛋白质组装成一类重要的细胞器——核糖体,而核糖体就是蛋白质合成的场所——“装配车间”。所以三种RNA的作用主要是参与蛋白质的生物合成。tRNA上的反密码当然应能识别mRNA上相应的、互补的密码,并与之配对。然而用提纯的tRNA来进行实验时,发现一种tRNA能够识别几种密码。例如,丙氨酸tRNA,其反密码为IGC(5′>3′),可以识别三种密码。rRNA与多种蛋白质分子共同构成**白体。**白体相当于“装配机”,能促使tRNA所携带的氨基酰基缩合成肽。**白体附着在mRNA上,并沿着mRNA长链的起始信号向终止信号移动。至于rRNA在蛋白质生物合成中的具体作用还不清楚。再采集样本之后马上加入 DNA/RNA Shield,可以快速降解掉 RNase 等蛋白物质。
RNA提取注意事项:使用时一定要根据自己的实验需要购买**提取试剂盒, 如果不是**试剂盒,或许能提出RNA,但不能确保其质量以及完整性,会影响RT-PCR、Northern blot、Dot blot、Real time RT PCR、芯片分析、polyA 筛选、体外翻译、RNase 保护分析、分子克隆等后续实验的结果。当前提取效果好的是RNA提取试剂盒,但其售价较高,单次实验费用花费太大,对精度要求不高的实验没有必要购买,当然还有其它的进口试剂盒,但是均存在价格高、订货周期长的问题(如果碰上国内无货的时候,要从国外发货,会等很长一段时间)。普通的提取实验用国产的试剂盒就足以,价格不高,基本上各地均有现货(国内生产的试剂盒中销售面比较广的一种)等,其价格比进口试剂盒要便宜许多,且效果还不错,性价比还可以。以及参与RNAi作用的miRNA与siRNA等,可调节基因表达。厦门RNA提取试剂进货价
其价格比进口试剂盒要便宜许多,且效果还不错,性价比还可以。南昌正规RNA提取试剂单价
细胞RNA提取的方法:异丙醇主要用于沉淀RNA。取出EP管后可以见到侧壁沉淀,轻轻吸弃上清。向EP管中加入75%酒精洗涤沉淀,帮助分离剩余的有机试剂(剩余有机试剂过多会影响OD值和PCR反应),轻弹沉淀,使其浮在酒精,静置1-2min,让酒精充分接触沉淀,充分溶解有机试剂,然后4度离心5min。轻轻吸弃上清。将EP管再次放于离心机中瞬时离心,弃掉管壁残余液体。然后将EP管置于超净台中干燥5-10min.。注意RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。加入50ul DEPC处理水,震荡充分溶解沉淀。测量RNA浓度。将RNA保存于-80度。南昌正规RNA提取试剂单价
miRNA是一类内源性的约22个核苷酸的非编码RNA分子,可参与转录后的基因调控。在细胞的分化和发育,细胞信号转导和对传染的应答等生物学过程中,miRNA发挥了重要作用。成熟的miRNA主要通过翻译压制来调控内源性基因的表达。miRNA的应用有miRNA模拟物和压制剂。miRNA模拟物是化学合成的双链RNA分子,通过传染到细胞中,模拟成熟的内源性miRNA分子;miRNA压制剂是单链经过修饰的RNA分子,通过传染到细胞中,特异性的压制miRNA的功能。miRNA模拟物和压制剂可以用于研究单个miRNA错误调节所造成的生物学影响,也能用于确定某个miRNA分子的特异性靶标基因。同时有研究发现mi...