**个体化诊疗
通过检测T790M位点突变情况,可以更好地评估一代TKI***的疗效及耐药情况并指导第三代TKI靶向药Osimertinib的使用。然而,由于qPCR平台ARMS检测技术的灵敏度有限,没有办法在含大量EGFR基因野生型背景核酸中高效准确的检测到T790M突变。这个时候dPCR技术展现出了****的检测精度,此外,dPCR***定量的优势也能充分发挥出来了,可以监控突变含量变化,做到及早发现耐药。
2.)基因表达分析
伊马替尼(Imatinib)可以有效帮助很多慢性髓细胞白血病(CML)患者延长生存期,但是临床上发现,伊马替尼的疗效与BCR-ABL1融合基因的转录产物表达量有很大的关系。研究人员采用dPCR对CML患者的BCR-ABL1融合基因转录产物进行测定,结果检测下限可以达到0.001%,显示出dPCR在痕量核酸检测方面比qPCR具有无可比拟的优势 采用有限稀释的方法将目标分子分割到**的反应体系中。上海广州永诺数字PCR原理
定量PCR和数字PCR的特点:
5. 目前定量PCR已经能实现高通量样品条件下的自动化操作。
6. 数字PCR在单分子层面上的***定量,可以彻底摆脱对标准曲线的依赖而直接给出靶序列的拷贝数,提高了实验结果在批内和批间的稳定性,甚至能用来对标准品进行定标。
7. 基于***定量的方式,数字PCR结果的高重复性和高精度可实现微小差异的基因表达分析,如等位基因的不平衡表达、单细胞基因表达分析、microRNA表达分析等等。所谓“微小差异”的标准一般而言是指表达水平的差异在2倍以内。
8. 同等条件下,数字PCR在灵敏度方面拥有优势,使得该技术已成为**的液态活检、病原微生物检测、转基因成分测定、宿主残留DNA分析等的热门技术。
研究方向
低丰度及稀有序列的精确定量
目前对于低丰度目标序列的检测,定量PCR、杂交、毛细管测序及NGS等方法都因受到背景DNA的干扰,使得检测灵敏度及精确性都达不到精细定量的要求(如定量PCR检测中Ct值大于33的情况下,其重复性就不是很高), 而微滴式数字PCR系统通过**的微滴 化处理,使得稀有的核酸序列从大量的背景DNA中分离出来,从而提高了检测的灵敏度及重复性。
此外,由于样品微滴化处理的同时,也将样品中可能存在的***剂进行了分装,提高了数字PCR扩增对于***剂的耐受程度,因此可具体应用于很多临床样品(血液、尿液、粪便、痰液、脑脊液等)中对**核酸标记物的检测。一般而言,毛细管电泳和定量PCR的检测灵敏度约在10%;NGS的灵敏度可达到1%;而ddPCR的检测下限为0.001%。
数字PCR通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元(微滴),包含一个或多个拷贝的核酸分子(也就是说我们所说的 DNA 模板) ,这是与PCR或qPCR反应比较大的区别,PCR或qPCR只在一个反应体系中进行,而数字PCR在每个反应单元(微滴)中都会对目标分子进行扩增,扩增结束后统计荧光信号并分析。是不是听起来特别高(yi)大(lian)上(meng)?举个栗子,PCR或qPCR检测突变像是在大海里捞一个会发光的针,周围都是海水,很难看到针的光在哪,而dPCR就像把海水盛到好多个碗里面,瞧一眼很容易就知道哪个碗在发光了,而且,系统还会数出来到底有多少个碗里是发光的,多少个碗里是没发光的,这样一比,不就很容易的知道有多少数量的突变,就能做到***定量了。可使用第三方PCR反应液,配备PCR A300(温度范围4°C-98°C,扩增模块温控精度±0.2°C)。
在定量PCR时,我们常常纠结一个问题,究竟是相对定量还是***定量呢?如今,你无需纠结了,因为数字PCR(digital PCR)来了。尽管这两种技术有些类似,都是估计起始样品中的核酸量,但它们有一个重要的区别。定量PCR是依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,而数字PCR则让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的***定量。因此特别适用于依靠Ct值不能很好分辨的应用领域:拷贝数变异、突变检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。20微升体系生成100,000微滴。南通流式数字PCR正规代理
2个光电倍增管(PMT),灵敏度及增益优于MPCC或CCD。上海广州永诺数字PCR原理
MicroDrop-100微滴式数字PCR 应用范围如下:
a. 动植物检验检疫,动物源性分析、极微量病原菌检测定量分析、转基因产品检测;
b. 降低筛查成本、缩短检测周期,适用于T13\T18\T21三体综合征等遗传病的风险评估;适用于zhong瘤早期筛查、分子分型、靶向用药和疗效监测等;适用于传染性疾病的早期诊断和诊疗指导;
c. 可用于DNA甲基化的检测、CRISPR-Cas9基因编辑效率检测等。
d.基因表达差异监测单细胞研究:测序、PCR
e.无创产前筛查:低成本、快速、传染性疾病:HBV、HIV、COVID-19 定量
上海广州永诺数字PCR原理
MicroDrop-100数字PCR系统具有如下优点:1、JUE对定量,结果判读不需要依赖标准曲线;2、突破局限,检测灵敏度可低至万分之一;3、专利设计的具有高精度复杂三维微纳防污染结构的微流控芯片,单张可同时处理1-8个样本;4、一键式自动操作,20uLPCR体系可生成100,000微滴,8个样本单次微滴生成 需2分钟;5、FAM、HEX(VIC)双荧光通道,半导体激光器做为激发光源相比LED光源,稳定性高,功率稳定不影响检测灵敏度,单色性能优异降低对检测特异性的影响,且方向性好;6、检测器为2个光电倍增管,灵敏度及增益优于MPCC或CCD,普通的硅光子计数器,增益为10^5,光电倍增管增益...