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染色体免疫共沉淀是基于体内分析发展起来的方法,也称结合位点分析法,在过去十年已经成为表观遗传信息研究的主要方法。这项技术帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。近年来,细胞实验外包中的这种技术得到不断的发展和完善。采用结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析**、心血管疾病以及***系统紊乱等疾病的主要通路的一种非常有效的工具。
做RIP的时候和beads孵育的lysate的浓度如何确定?有些动物的文献提到用细胞板数细胞个数,想知道如果用蛋白浓度的话,大概在什么数量范围的蛋白总量对应50ulBEADS?细胞实验外包。50ulbeads对应的是一个reaction,而我们推荐一个reaction是100ul裂解上清(2×107cells加入100ulRIPlysisbuffer得到),所以只需要在裂解前计数一下,并按括号中的比例加入裂解buffer,后续100ul裂解上清就是一个reaction的蛋白用量。不建议通过裂解后测蛋白浓度的方法进行配比。细胞实验外包样品制备步骤。
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因为RIP做完得到的是RNA序列,要做后续检测,比如测序、判断目标序列位置等,是不是都必须要做RT-PCR,得到逆转录的DNA后,后面就跟ChIP相同了?细胞实验外包。常见的用realtimeqRT-PCR。如果对照的目的是保证两个样品间加入的细胞量一致或者进行定量,理论上说,使用input作为判别,计算不同样品上样量的差异。如果对照的目的是为了看IgG以及目的抗体富集的非特异性mRNA的量的话,那么可以找一个确定不会与目的抗体结合的RN**段设计primer进行qPCR,用来看IgG以及目的抗体拉下来的背景情况。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,但由于研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物,RIP实验的优化条件与ChIP实验不太相同(如复合物不需要固定,RIP反应体系中的试剂和抗体相对不能含有RNA酶,抗体需经RIP实验验证等等)江苏生物细胞实验外包选择
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