云南哪里有二代测序应用

一代、二代、三代测序的区别分别是什么？

一代测序是上世纪70年代由Sanger和Coulson开创的DNA双脱氧链终止法测序，也称为Sanger测序。

二代测序技术(NGS)是为了改进一代测序通量过低的问题而出现的，能够同时对上百万甚至数十亿个DNA分子进行测序实现了大规模、高通量测序的目标。

三代测序主要有两种技术PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的纳米孔单分子测序技术，这两种技术的测序读长都可以达到几-kb的级别，远远高于二代测序技术。 二代测序包括全基因组测序和全外显子测序。云南哪里有二代测序应用

二代测序——蛋白质甲基化

概念及位置：蛋白质甲基化是指在蛋白质的氨基酸残基上添加甲基基团。常见的甲基化修饰位点包括精氨酸（Arg）和赖氨酸（Lys）残基。

作用

1、调节蛋白质 - 蛋白质相互作用：例如，组蛋白（染色体的组成成分）的甲基化可以改变染色质的结构和功能，影响基因的可及性。当组蛋白 H3 的赖氨酸残基（如 H3K4、H3K9 等）发生甲基化时，会招募不同的蛋白质复合物，从而***或抑制基因转录。2、调节酶的活性：某些酶的活性可以通过蛋白质甲基化来调节。甲基化可能改变酶的活性中心的结构或者影响其与底物的结合能力。

检测方法：质谱分析：这是一种***用于检测蛋白质甲基化的方法。它能够精确地确定蛋白质分子的质量，通过比较甲基化和未甲基化蛋白质的质谱图，可以鉴定甲基化位点和修饰程度。 徐汇区嘉安健达二代测序检测扩增子测序是二代测序吗？

①二代测序一般多久出结果？

二代测序（Next-GenerationSequencing，NGS）出结果的时间会受到多种因素的影响，一般在数天到数周不等。

1、样本类型和质量

不同的样本类型处理时间不同。例如，血液样本相对容易处理，提取DNA的过程比较常规。如果是组织样本，可能需要先进行样本的解离等复杂操作。如果样本质量高，DNA提取和文库构建等前期工作会比较顺利，能加快整体进程。但如果样本量少或者DNA有降解等质量问题，可能需要重新提取样本或者进行DNA修复等操作，这会**延长时间。例如，对于新鲜血液样本，DNA提取可能在1-2天内完成；而对于一些福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本，可能需要3-5天来完成高质量DNA的提取和后续的优化处理。

关于二代测序的简介：

二代测序技术(Next-Generation Seguencing,NGS)也称为高通量测序技术，是一种能够同时对数百万甚至数十亿个 DNA片段进行测序的方法。与传统的桑格测序相比二代测序技术具有高通量、高准确性、高灵敏度和低成本等优势。

二代测序技术在大幅提高了测序速度的同时，大幅度的降低了测序成本，保持了高准确性，以前完成一个人类基因组的测序需要3年时间，而使用二代测序技术则需要1周，但其序列读长方面比起一代测序技术则要短很多，大多只100bp-150bp。

一代和二代测序的区别？

二代测序——数据分析类问题

二代测序数据分析的主要内容和挑战是什么：主要内容包括数据的质量控制、序列比对、变异检测、基因表达定量、功能注释等。挑战在于数据量巨大，需要高效的计算资源和复杂的生物信息学算法来处理；数据质量参差不齐，需要严格的质量控制和过滤；变异解读复杂，需要结合生物学知识和数据库进行准确的评估。如何从海量的二代测序数据中筛选出有意义的信息：通过设定合理的质量控制标准过滤低质量数据，然后根据研究目的进行针对性的分析，如在疾病研究中，重点关注与疾病相关的基因区域的变异和表达变化；利用已知的生物学数据库和功能注释信息对检测到的变异和基因进行注释和筛选，优先关注那些对蛋白质功能、基因调控等有***影响的变异和差异表达基因。 二代测序常用于医学筛查或诊断。四川哪里有二代测序提供

单细胞测序属于二代测序吗？云南哪里有二代测序应用

②二代测序一般多久出结果？

2、测序平台和通量

不同的二代测序平台有不同的通量（一次能测序的样本数量和数据量）和测序速度。一些高通量的测序平台，如IlluminaNovaSeq系列，能够在较短时间内产生大量的数据。但如果使用的是通量较低的小型测序仪，或者测序仪的运行时间被多个项目分配，都会影响结果产出的时间。例如，在高通量平台上进行全基因组测序，测序运行时间可能在2-7天左右，具体取决于测序深度等因素。而对于一些小型台式测序仪进行靶向基因测序，运行时间可能在1-3天。 云南哪里有二代测序应用

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