在反应过程中,荧光染料或荧光标记的探针会与扩增产物结合。非特异性扩增产物,如引物二聚体等,也会与荧光物质发生一定程度的结合并产生荧光信号。通过实时监测荧光信号的变化,可以察觉到这些非特异性产物的存在。反应结束后进行熔解曲线分析。不同的扩增产物包括特异性产物和非特异性产物,在升温过程中会在不同的温度下解链,从而导致荧光信号的变化。非特异性产物如引物二聚体通常具有独特的熔解温度,通过分析熔解曲线的峰形和位置,可以判断是否存在非特异性扩增产物。在实时荧光定量 PCR 技术中,Ct 值的确定对于定量分析起始模板的数量非常重要。qpcr荧光定量
实时荧光定量PCR(Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction,qPCR)是一种基于PCR技术的分子生物学方法,用于快速、灵敏和准确地定量测量目标DNA序列的数量。相较于传统的末端点PCR,实时荧光定量PCR可以在PCR反应过程中实时监测靶标DNA的扩增情况,通过荧光信号的累积来定量分析靶标序列的含量。实时荧光定量PCR已成为生物医学研究、临床诊断和分子生物学实验中的重要工具之一。实时荧光定量PCR的原理基于甲基蓝荧光染料或探针分子的荧光信号。在PCR反应过程中,当DNA聚合酶合成新链的过程与靶标DNA序列发生匹配时,荧光信号会逐渐累积。揭示荧光定量PCR标准曲线当荧光信号强度超过设定的阈值时,对应的循环次数即为循环阈值(Ct 值)。
非特异性扩增产物的扩增曲线可能会呈现出异常的形态,比如斜率、平台期等与特异性扩增不同。仔细观察和分析扩增曲线的细节,可以发现潜在的非特异性扩增情况。如果有已知的标准品和标准曲线,当检测到的结果与标准曲线出现较大偏差时,可能提示存在非特异性扩增产物的干扰。一些实时荧光定量 PCR 系统具有多个检测通道,可以同时使用不同的荧光标记来区分特异性产物和非特异性产物。例如,用特定的荧光标记检测特异性扩增产物,而用另一种荧光标记来监测可能的非特异性产物。
PCR产物熔解曲线的Tm值和峰形可以用于评估PCR产物的特异性。如果PCR产物是特异性扩增的,熔解曲线将呈现出清晰的单峰或双峰;反之,如果存在非特异扩增产物或引物二聚体等问题,熔解曲线将出现异常的峰形,提示PCR产物的特异性可能存在问题。PCR产物熔解曲线的形态和峰值也可以反映PCR产物的纯度。如果PCR产物存在杂交物或非特异扩增产物,熔解曲线可能会出现多个峰或平台,表明PCR产物的纯度可能较低。通过优化PCR反应条件和引物设计,可以提高PCR产物的纯度,确保实验结果的准确性。Ct 值与起始模板的数量成反比关系。即起始模板数量越多,Ct 值越小;起始模板数量越少,Ct 值越大。
适温延伸阶段。在这一阶段,温度通常在 70℃至 75℃左右。DNA 聚合酶开始发挥其关键作用。DNA 聚合酶能够以单链 DNA 为模板,按照碱基互补配对原则,逐个添加核苷酸,从而延伸出一条新的 DNA 链。这个过程就像是在构建一座宏伟的大厦,DNA 聚合酶是辛勤的建筑工人,一砖一瓦地搭建起新的 DNA 结构。适温延伸的温度选择同样需要谨慎考虑,既要保证 DNA 聚合酶的活性,又要避免非特异性的扩增。高温变性、低温复性和适温延伸,构成了一个完整的热循环。一次热循环结束后,新合成的 DNA 链又可以作为模板,进入下一次循环。通过不断重复这一热循环过程,我们可以实现p片段的指数级扩增。在 PCR 反应的早期阶段,荧光信号主要来自非特异性的背景荧光和引物二聚体等的荧光。实时定量pcr技术总结
外参法是通过建立标准曲线,利用已知浓度的外部标准样品与待测样品进行比对,实现对目标DNA数量的测定。qpcr荧光定量
扩增产物长度对PCR反应的特异性影响,在PCR反应中,扩增产物的长度会直接影响引物的结合和延伸效率。通常来说,引物与目标DNA序列的互补长度应该适中,过短会导致引物不能有效地结合,使扩增产物的特异性降低,而过长则会降低引物的延伸效率。因此,合适长度的扩增产物能够保证PCR反应的特异性和准确性。总的来说,扩增产物的长度会直接影响PCR反应的特异性、效率和产物纯度,因此在PCR实验中需要根据具体实验目的和引物设计的要求来选择合适长度的扩增产物,以确保PCR反应的成功和准确性。qpcr荧光定量