支原体检测中的PCR法和LAMP方法各有其优势和劣势,以下是两种方法的比较:
PCR法
优势:
1.高灵敏度:PCR法可以扩增支原体DNA,具有很高的灵敏度。
2.操作简便:PCR操作相对简单,结果准确,速度快,通常3个小时左右即可得到结果。
3.可靠性:PCR法已成为日常细胞培养维护的可靠方法,是细胞样本库保护细胞的方法。
劣势:
1. 样品量需求:相对于某些快速检测方法,PCR可能需要较多的样品量。
2. 检测周期:尽管PCR法相对快速,但在某些情况下,检测周期可能较长。
LAMP法
优势:
1. 设备简单:只需要一个稳定的恒温环境,如恒温水浴或热拟温器,不需要复杂的温度控制设备。
2. 高特异性:LAMP技术采用多个特异性引物,提供了较高的特异性。
3. 结果可视化:LAMP扩增产物可形成肉眼观察的颜色产物,有助于直接观察扩增结果。
劣势:
1. 引物设计复杂:需要设计多个引物,包括外部引物、内部引物和环引物,引物设计较为复杂。
2. 避免污染:由于没有封闭系统,避免污染造成的假阳性是一个问题。
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细胞培养中支原体难以彻底消灭的原因主要包括以下几点:
1. 无细胞壁结构:支原体是没有细胞壁的微生物,这使得许多作用于细胞壁的抗*素对支原体无效。
2. 微小体积:支原体体积小,能够穿过常规的除菌滤膜,例如0.20微米甚至0.10微米的滤膜。
3. 隐匿性:支原体污染初期很难被察觉,它们在普通光学显微镜下几乎不可见,因此细胞被支原体污染后,前期很难被发现。
4. 传播途径多样:支原体可以通过细胞培养物、细胞悬液、细胞培养用具等途径迅速传播。
5. 污染源 :支原体污染源包括细胞间的交叉污染、操作人员的口腔、皮肤,以及细胞培养用的组分如血清、培养液等。
6. 环境因素:实验室环境、试验台、超净台、培养箱等可能被支原体污染,引起细胞的污染。
7. 抗*素耐药性:支原体可能对某些抗*素产生耐药性,使得治*效果变差。
8. 检测和清理方法的局限性:一些传统的支原体检测和清理方法可能不够灵敏或有效,导致难以彻底清理支原体
支原体检测方法PCR法细胞培养支原体污染怎么检测?
对于同一个样品,如果一步法恒温试剂盒检测结果为阳性,而PCR检测为阴性,可能的原因包括:
1. 检测的支原体种类不同:一步法恒温试剂盒可能检测的支原体种类更多,例如可以涵盖27种支原体,而PCR检测可能只针对常见的12种支原体进行检测。因此,如果样品中污染的支原体种类不在PCR检测的范围内,就可能出现一步法检测为阳性而PCR检测为阴性的情况。
2. 灵敏度的差异:PCR方法的灵敏度可能高于一步法恒温检测法。PCR可以检测到低至单个拷贝的支原体,而一步法恒温检测可能需要更高的支原体拷贝数,例如10^3^个拷贝。如果样品中支原体的数量低于一步法检测的灵敏度阈值,PCR检测可能无法检测到,导致阴性结果。
3. 样品中可能含有抑制PCR反应的物质:如果样品中存在PCR反应的抑制物,可能会影响PCR的扩增效率,导致即使存在支原体,PCR检测也可能呈现阴性结果。
4. 试剂盒的特异性和交叉反应:一步法恒温试剂盒可能具有更高的特异性,减少了与其他微生物的交叉反应,从而在PCR检测为阴性时仍能准确检测到支原体的存在。
细胞培养中支原体污染的检测方法有多种,以下是一些常用的检测手段:
1. 显微镜检测:通过相差显微镜观察细胞,支原体在细胞表面和细胞之间会呈现为暗色微小颗粒。
2. 荧光染色法:使用荧光染料Hoechst 33258与DNA特异性结合,使支原体的DNA着色,然后在荧光显微镜下观察。染色后的支原体会在细胞周围或附于细胞膜表面显示为亮绿色小点。
3. 电镜检查:使用扫描电镜或透射电镜观察,这是一种简便快速的方法。
4. 聚合酶链反应(PCR):使用特定的引物对支原体DNA进行扩增,是一种高灵敏度的检测方法。
5. 等温扩增法:基于LAMP技术,室温反应后观察颜色变化确认是否有支原体污染。
支原体检测的应用场景?
支原体是细胞外生存的 小微生物,是一类缺乏细胞壁的原核细胞型微生物,大小一般在0.2~0.5um之间,呈高度多形性,有球形、杆形、丝形、分枝状等多种态。
1、支原体存在于我们周围,他可能就如尘埃一样存在于我们的环境中
2、可透过一般的滤膜,所以不要寄希望于过滤可以清楚支原体污染的液体
支原体对培养细胞的污染发生率高,据估计平均发生率在60%左右。同时又非常隐秘,早期不容易被发现,除非用特异性和灵敏度都非常高的检测试剂盒。支原体因为个头小,能穿过0.22微米滤器,并且在实验室内会潜在的扩散。支原体污染使得用被污染的细胞样本做的实验完全失去意义和价值。
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对于同一个样品,如果PCR检测结果为阳性而一步法恒温检测试剂盒结果为阴性,可能的原因包括:
1. 灵敏度差异:PCR方法通常具有较高的灵敏度,可以检测到单个拷贝的支原体DNA。相比之下,一步法恒温检测试剂盒可能需要更高的支原体拷贝数才能检测出阳性结果,例如需要10^3个拷贝。如果样品中的支原体数量低于一步法试剂盒的检测阈值,就可能出现PCR阳性而一步法阴性的情况。
2. 检测范围:PCR检测可以针对特定的支原体序列设计引物,如果样品中的支原体种类或序列与一步法试剂盒的检测范围不完全匹配,可能导致一步法检测不出。
3. 样品处理和提取:一步法恒温检测试剂盒可能对样品的处理和DNA提取有特定的要求。如果样品处理不当或DNA提取效率不高,可能会影响一步法试剂盒的检测结果。
4. 试剂盒特异性:一步法恒温检测试剂盒可能设计用于检测特定的支原体种类,如果样品中的支原体与试剂盒的特异性不匹配,可能导致假阴性结果。
5. 抑制物的影响:PCR检测可能对样品中的某些抑制物不那么敏感,而一步法恒温检测试剂盒可能更容易受到这些抑制物的影响,从而降低检测的灵敏度。
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