免疫沉淀技术RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)是一种用于研究细胞内RNA与蛋白质相互作用的技术。RIP技术可以帮助我们了解转录后调控网络的动态过程,并发现miRNA等非编码RNA的调节靶点。
RIP技术的原理是利用针对特定RNA结合蛋白的抗体,将细胞内的RNA-蛋白质复合物沉淀下来。然后,可以通过分离纯化,对这些复合物中的RNA进行检测,如qPCR验证或测序分析。
表观遗传学和RNA生物学领域对不同RNA作用和功能的关注增加。RNA-蛋白质相互作用能够调控mRNA和非编码RNA的功能。对RNA潜能的这一新认识带动了新方法的发展,使研究人员能够定位 RNA-蛋白质相互作用。
免疫沉淀ChIP技术选琼脂糖珠还是磁珠?上海Protein AG免疫沉淀磁珠货期
免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)的实验方法通常包括以下步骤:
1. 样本准备
2. 蛋白质浓度测定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。
3. 抗体预处理:如果使用预固定的抗体,需先将抗体固定在固相支持物上,如琼脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反应:将裂解液与特异性抗体(固定或未固定)混合,并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜,以允许抗体与目标蛋白质充分结合。
5. 固相支持物的回收:对于未固定的抗体,加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。
6. 洗涤:去除未结合的蛋白质和杂质,通常需要多次洗涤固相支持物。
7. 洗脱:使用适当的洗脱缓冲液(如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液)从固相支持物上洗脱免疫复合物。
8. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等,以进一步分析目标蛋白质。
广州蛋白免疫沉淀磁珠应用免疫沉淀纯化所得抗原量低是什么原因?
免疫沉淀IP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
Co-IP的实验步骤:
1. 细胞裂解:首先,细胞或组织被裂解,释放其中的蛋白质。
2. 抗体结合:然后,将特异性抗体(针对已知蛋白质之一的抗体)加入到裂解物中。这些抗体会特异性地结合到目标蛋白(诱饵蛋白)上。
3. 免疫复合物形成:抗体与目标蛋白结合后,形成免疫复合物。
4. 沉淀:接着,使用蛋白A或蛋白G结合的珠子(如琼脂糖或磁性珠子)来捕获免疫复合物。蛋白A或蛋白G能够与抗体的Fc部分结合,从而拉下抗体以及与之结合的目标蛋白和任何相关的相互作用蛋白。
5. 洗涤:捕获的免疫复合物被洗涤以去除未特异性结合的蛋白质。
6. 洗脱和分析:免疫复合物被洗脱并进行进一步的分析,如Western blot(WB)或质谱分析,以鉴定相互作用的蛋白质。
免疫沉淀技术Co-IP的优缺点是什么?
免疫沉淀作为一种精细的生物技术工具,在深入探究生物分子的特性和功能方面展现出了独特的优势。在研究蛋白质的构象变化方面,免疫沉淀发挥着重要作用。蛋白质的构象决定了其功能,而某些外界因素或生理过程可能导致蛋白质构象的改变。通过免疫沉淀特定状态下的蛋白质,并结合结构分析技术,如X射线晶体衍射或核磁共振,能够精确地解析蛋白质构象的变化,进而揭示其功能调节的机制。对于蛋白质与核酸的相互作用研究,免疫沉淀也是一种有效的手段。例如,在基因转录过程中,转录因子与DNA的结合对于调控基因表达至关重要。通过免疫沉淀特定的转录因子,可以同时沉淀与其结合的DNA片段,从而确定转录因子在基因组上的结合位点,揭示基因转录调控的分子机制。此外,免疫沉淀在研究蛋白质的泛素化修饰方面具有重要应用。泛素化修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰,参与了许多细胞过程的调控。通过免疫沉淀泛素化的蛋白质,可以解析其泛素化位点和修饰模式,深入了解泛素化在蛋白质降解、信号转导等过程中的作用。免疫沉淀技术IP的应用有哪些?杭州IP免疫沉淀选磁珠还是琼脂糖珠
免疫沉淀Co-IP技术选琼脂糖珠还是磁珠?上海Protein AG免疫沉淀磁珠货期
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验方法概述:
1. 交联:将细胞与交联剂(如1%甲醛)孵育,通常在室温下进行10-15分钟。
2. 终止交联:添加甘氨酸以终止交联反应,孵育5分钟。
3. 收集细胞:通过离心收集细胞,并用PBS洗涤以去除交联剂。
4. 细胞裂解:使用裂解缓冲液裂解细胞,释放染色质。
5. 染色质剪切:使用超声波或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段。
6. 免疫沉淀:将剪切后的染色质与特异性抗体孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗涤:用低盐、高盐和LiCl洗涤液洗涤磁珠,去除非特异性结合物。
8. 洗脱:用洗脱缓冲液洗脱DNA。
9. 逆转交联:用蛋白酶K处理,然后在65°C下加热过夜以逆转交联。
10. DNA纯化:使用商业试剂盒或标准酚/氯仿方法纯化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或进行测序以确定蛋白质结合位点。
上海Protein AG免疫沉淀磁珠货期