ChIP实验的基本步骤包括:
1. 交联(Crosslinking):细胞被甲醛等交联剂处理,使得蛋白质和DNA之间的相互作用被固定,形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
2. 细胞裂解:裂解细胞,释放染色质,同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
3. 超声或酶解:通过超声或酶解将染色质切割成较小的片段,以便于后续步骤中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀(Immunoprecipitation):加入针对特定组蛋白修饰或转录因子的抗体,这些抗体会特异性地结合到目标蛋白质上。
5. 捕获复合物:使用蛋白A或蛋白G结合的珠子捕获抗体-蛋白质-DNA复合物。
6. 洗涤:洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和DNA片段。
7. 逆转录交联:将捕获的复合物从珠子上洗脱,并进行逆转录交联,使固定的蛋白质-DNA复合物分离。
8. DNA纯化:纯化从免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析:通过qPCR、芯片分析(ChIP-chip)或高通量测序(ChIP-seq)等方法分析沉淀的DNA片段,以确定特定蛋白质在基因组上的结合位点。
免疫沉淀的操作步骤?广州Protein AG免疫沉淀外包公司
免疫沉淀技术RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的实验方法基于以下几个关键步骤:
1. 细胞裂解:首先,细胞或组织样本被裂解,以释放细胞内的蛋白质和RNA复合物。
2.抗体特异性结合:裂解后的样本中加入针对特定RNA结合蛋白的抗体。这些抗体能够特异性地识别并结合到目标蛋白。
3. 免疫复合物形成:抗体与目标蛋白结合后,形成抗体-蛋白质-RNA复合物。
4. 亲和介质捕获:使用蛋白A或蛋白G结合的珠子(如琼脂糖或磁性珠子)来捕获这些抗体-蛋白质-RNA复合物。蛋白A或蛋白G能够与抗体的Fc部分结合,从而拉下与之结合的复合物。
5. 洗涤:捕获的复合物被洗涤以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。
6. RNA分离和分析:从珠子上洗脱或消化复合物,分离出RNA,并进行进一步的分析,如qPCR、Northern blot或高通量测序(RNA-Seq)。
南京anti DYKDDDDK免疫沉淀外包公司免疫沉淀技术RIP的原理是什么?
免疫沉淀技术(Immunoprecipitation,简称IP)是一种生物化学方法,它利用特异性抗体对抗原进行亲和纯化。在含有目的抗原的细胞裂解液中加入特定的抗体以及Protein A/G-Beads(预先将Protein A/G固定结合在磁珠上),根据抗原与抗体、Protein A/G与抗体的Fc的特异性,形成“抗原-抗体-Protein A/G-Beads”复合物,清洗离心后去除溶液中未结合的杂蛋白,检测是否存在目的蛋白。
免疫沉淀技术常用于从细胞或组织裂解物中分离用于免疫印迹检测或其他检测技术的蛋白和其他生物分子。它的目标是分离足够用于Western Blot或其他检测方法检测的蛋白质。
Co-IP(免疫共沉淀)技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用,其实验设计如下:
1. 样品准备:Co-IP实验通常有两种,一种是内源性蛋白相互作用验证,一种是非内源性蛋白相互作用验证。内源性相互作用通过质粒共转染的方式将两种蛋白转染至同一细胞内表达;非内源性相互作用则是将含有靶蛋白的组织进行预处理及细胞裂解获得细胞裂解液。
2. 沉淀诱饵蛋白:利用磁珠偶联抗体沉淀诱饵蛋白。在样品中加入磁珠偶联抗体,抗体会与诱饵蛋白结合,利用磁铁将磁珠拉下,同时诱饵蛋白会一起被沉淀出来。
3. SDS-PAGE及WB检测:得到沉淀后,需要验证沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE将蛋白复合物分离,随后利用WB检测是否存在靶蛋白。
4. 实验对照设置:为了避免“假阳性”,需要设置正确的对照,包括阴性对照和阳性对照(Input组)。Input组为直接利用抗体对细胞裂解液进行WB检测,验证细胞裂解液中存在蛋白。
5. 结果真实性:确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白。使用单克隆抗体有助于避免污染的发生。
免疫沉淀IP技术选琼脂糖珠还是磁珠?
免疫沉淀(immunoprecipitation)是指利用抗体可与抗原特异性结合的特性,将抗原(常为靶蛋白)从混合体系沉淀下来,初步分离靶蛋白的一种方法。免疫共沉淀(coimmunoprecipitation)是一种在体外探测两个蛋白分子间是否存在特异性相互作用的一种方法。其原理非常简单,如果两个蛋白在体外体系能够发生特异性相互作用的话,那么当用一种蛋白的抗体进行免疫沉淀时,另一个蛋白也会被同时沉淀下来。与酵母双杂交技术不同,免疫共沉淀技术所利用的是抗原和抗体间的免疫反应,是一种基于体外非细胞的环境中研究蛋白质与蛋白质的相互作用的方法。
免疫沉淀技术的实验方法。上海ChIP免疫沉淀磁珠哪个公司好用
免疫沉淀技术ChIP的原理是什么?广州Protein AG免疫沉淀外包公司
免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)的实验设计通常包括以下几个关键步骤:
1. 目标蛋白质的选择:
2. 抗体的选择:选择特异性强、亲和力高的抗体来捕获目标蛋白质
3. 样本的准备:收集和准备细胞或组织样本。
4. 蛋白质的裂解和释放:选择合适的裂解条件,如pH值、离子强度、去污剂等。
5. 蛋白质浓度的测定:确定裂解液中蛋白质的浓度,以便于后续步骤的标准化。
6. 免疫沉淀的操作:将特异性抗体与裂解液混合,并在适宜的条件下孵育,以形成抗体-抗原复合物。
7. 非特异性结合的减少:通过预纯化步骤去除可能的非特异性结合蛋白。
8. 洗涤:多次洗涤以去除未结合的蛋白质和杂质。
9. 目标蛋白质的洗脱:使用适当的缓冲液洗脱抗体-抗原复合物。
10. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行进一步分析,如Western Blot.
11. 对照实验:设计适当的正对照和负对照,以评估实验的特异性和敏感性。
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