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深圳Co IP免疫沉淀实验原理

ChIP（染色质免疫沉淀）实验是一种强大的技术，用于研究蛋白质与DNA之间的相互作用，尤其是在转录调控、DNA修复、...

免疫沉淀基本参数

品牌
世途科生物
产品名称
免疫沉淀磁珠Protein A/G
有效期
12个月

免疫沉淀企业商机

ChIP（染色质免疫沉淀）实验是一种强大的技术，用于研究蛋白质与DNA之间的相互作用，尤其是在转录调控、DNA修复、复制以及表观遗传学领域。然而，像所有实验技术一样，ChIP实验也有其优点和缺点。

ChIP实验的优点：

1. 体内反应的反映：ChIP提供了一种在体内研究蛋白质与DNA相互作用的方法，能够真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白的调控信息。

2. 全基因组覆盖：ChIP技术可以覆盖整个基因组，提供关于蛋白质-DNA相互作用的视图。

3. 适用于多种蛋白质：ChIP可以用来研究组蛋白修饰、转录因子以及其他DNA结合蛋白。

ChIP实验的缺点：

1. 实验步骤繁琐。

2. 需要大量起始材料：ChIP实验通常需要大量的细胞或组织作为起始材料。

3. 交联的影响：使用交联剂可能会改变蛋白质的结构，从而影响抗体的识别和蛋白质-DNA的相互作用。

4. 染色质碎裂的分辨率：染色质碎裂的效率和分辨率直接影响ChIP的准确性，需要优化以获得结果。

5. 抗体质量：抗体的质量对实验结果至关重要，但高质量、特异性强的抗体可能难以获得或成本较高。

免疫沉淀技术的实验设计。深圳Co IP免疫沉淀实验原理

免疫沉淀实验步骤：

1. 样品制备

a. 悬浮细胞样品处理：离心收集细胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把细胞用力弹散。按照6孔板每孔细胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。

b. 贴壁细胞样品处理：移去培养基，用PBS清洗细胞两遍；用细胞刮棒刮脱细胞，收集至1.5mL EP管内，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。吹打数下，使裂解液和细胞充分接触。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。

4. 后续：磁珠预处理——抗体吸附——抗原结合反应——抗体洗脱

杭州Protein AG免疫沉淀实验视频免疫沉淀技术Co-IP的应用有哪些？

Co-IP的优势：

1. 生理相关性：Co-IP可以在接近生理条件的条件下捕获蛋白质相互作用。

2. 特异性：使用特异性抗体可以提高实验的特异性。

3. 广泛应用：Co-IP技术适用于多种样本类型，包括细胞培养、组织样本等。

Co-IP的局限性：

1. 抗体依赖性：需要高质量的特异性抗体，否则可能得到假阳性或假阴性结果。

2. 非特异性结合：可能存在非特异性结合问题，需要仔细的实验设计和对照来控制。

3. 技术挑战：对于低丰度或弱相互作用的蛋白质，Co-IP可能面临技术挑战。

RNA免疫沉淀技术（RIP）是一种研究RNA与蛋白质相互作用的重要方法，其应用领域主要包括：

1. 转录后调控研究：RIP技术可以帮助研究者了解RNA在转录后水平如何被调控。

2. 表观遗传调控：RIP技术用于研究RNA结合蛋白（RBPs）在表观遗传调控中的作用。

3. 非编码RNA功能研究：RIP技术可以用来研究长非编码RNA（lncRNA）、miRNA和其他小RNA的种类，以及它们如何与蛋白质相互作用来调控基因表达。

4. RNA病毒研究：RIP技术也可用于研究RNA病毒与其宿主细胞内蛋白质的相互作用，进而了解病毒复制和致病机制。

5. RNA修饰和甲基化研究：RIP技术结合其他技术如m5C-RIP-seq，可用于研究RNA甲基化修饰及其在病理过程中的作用。

6. RNA定位和稳定性：通过RIP技术，研究者可以探索特定RNA在细胞内的定位以及它们如何被稳定或降解。

7. RNA-蛋白质复合物的鉴定：RIP技术可以用来鉴定与特定RNA结合的蛋白质，从而揭示RNA-蛋白质复合物的组成。

8. 疾病相关RNA研究：RIP技术在疾病相关RNA的研究中也有应用。

免疫沉淀样本的制备。

免疫沉淀实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。

琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ，它能够直接高效、快速结合抗体，而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构，这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触，具有更高的结合载量。

与琼脂糖珠不同，磁珠是固体，抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠，尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力，但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多，使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。

简而言之，琼脂糖珠的结合能力较强，而磁珠在得率，可重复性以及自动化方面有明显的优势。

免疫沉淀ChIP技术选琼脂糖珠还是磁珠？北京免疫沉淀磁珠原理

免疫沉淀技术Co-IP是什么？深圳Co IP免疫沉淀实验原理

RIP实验步骤通常包括：

1. 细胞收集与交联：培养细胞至适当密度。使用交联剂（如甲醛）进行交联，以固定蛋白质-RNA复合物。

2. 细胞裂解：收集细胞并进行裂解，释放RNA-蛋白质复合物。在裂解过程中添加蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解。

3. 超声处理：使用超声波破坏细胞，获得更小的染色质片段，这有助于后续步骤中抗体的接触。

4. 除去细胞碎片：通过离心去除细胞碎片和未裂解的细胞，收集含RNA-蛋白质复合物的上清液。

5. 免疫沉淀：将针对特定RNA结合蛋白（RBP）的抗体加入到上清液中。孵育一段时间，使抗体与目标蛋白充分结合。

6. 捕获免疫复合物：添加蛋白A或蛋白G结合的磁珠或琼脂糖珠。孵育使抗体-蛋白质-RNA复合物与珠子结合。

7. 洗涤：多次洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。

8. 洗脱与逆转交联：使用适当的缓冲液洗脱免疫复合物。使用蛋白酶K处理样品以逆转交联，释放RNA。

9. RNA提取与纯化：从免疫沉淀样品中提取RNA，并进行纯化。

10. RNA分析：使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA，以确定与目标蛋白相互作用的RNA种类。

深圳Co IP免疫沉淀实验原理

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