免疫沉淀技术的实验设计通常包括以下几个关键步骤:
1. 目标蛋白质的选择:
2. 抗体的选择:选择特异性强、亲和力高的抗体来捕获目标蛋白质
3. 样本的准备:收集和准备细胞或组织样本。
4. 蛋白质的裂解和释放:选择合适的裂解条件,如pH值、离子强度、去污剂等。
5. 蛋白质浓度的测定:确定裂解液中蛋白质的浓度,以便于后续步骤的标准化。
6. 免疫沉淀的操作:将特异性抗体与裂解液混合,并在适宜的条件下孵育,以形成抗体-抗原复合物。
7. 非特异性结合的减少:通过预纯化步骤去除可能的非特异性结合蛋白。
8. 洗涤:多次洗涤以去除未结合的蛋白质和杂质。
9. 目标蛋白质的洗脱:使用适当的缓冲液洗脱抗体-抗原复合物。
10. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行进一步分析,如Western Blot.
11. 对照实验:设计适当的正对照和负对照,以评估实验的特异性和敏感性。
免疫沉淀技术ChIP是什么?IP免疫沉淀磁珠原理
Co-IP(免疫共沉淀)技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用,其实验设计如下:
1. 样品准备:Co-IP实验通常有两种,一种是内源性蛋白相互作用验证,一种是非内源性蛋白相互作用验证。内源性相互作用通过质粒共转染的方式将两种蛋白转染至同一细胞内表达;非内源性相互作用则是将含有靶蛋白的组织进行预处理及细胞裂解获得细胞裂解液。
2. 沉淀诱饵蛋白:利用磁珠偶联抗体沉淀诱饵蛋白。在样品中加入磁珠偶联抗体,抗体会与诱饵蛋白结合,利用磁铁将磁珠拉下,同时诱饵蛋白会一起被沉淀出来。
3. SDS-PAGE及WB检测:得到沉淀后,需要验证沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE将蛋白复合物分离,随后利用WB检测是否存在靶蛋白。
4. 实验对照设置:为了避免“假阳性”,需要设置正确的对照,包括阴性对照和阳性对照(Input组)。Input组为直接利用抗体对细胞裂解液进行WB检测,验证细胞裂解液中存在蛋白。
5. 结果真实性:确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白。使用单克隆抗体有助于避免污染的发生。
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染色质免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技术是目前公认的研究此相互作用的选择,是真核生物基因表达机制研究中不可或缺的技术之一。
它的基本原理是在活细胞状态下,固定蛋白质-DNA(染色质)复合物,并将其切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法(抗体亲和)沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的 DNA,通过对目的片段的纯化与后期检测,从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。
这项技术通过蛋白质与DNA互作来分析目标基因活性以及已知蛋白质的靶基因,被广泛应用于体内转录调控因子与靶基因启动子上特异核苷酸序列结合方面的研究。该技术常与DNA芯片和分子克隆技术相结合。
免疫沉淀实验不同于WB实验的样品制备,对实验样品制备要求更高,除了要控制所有操作尽量在冰上完成外,关键的是裂解液的成分,裂解液成分直接决定了样品质量。
主要影响:
1. 蛋白的释放:许多目的蛋白定位在细胞器,质膜,细胞核,细胞骨架中,但通常这些亚细胞结构很难被裂解液有效溶解,所以很难将这些蛋白释放出来。
2. 蛋白相互作用:不同去垢剂对不同性质的蛋白质间相互作用影响程度不同,一些互作较弱的蛋白对尽管在比较温和的裂解液配方中仍然会被破坏。
免疫沉淀技术的优缺点?
ChIP技术的应用:
1. 转录因子结合位点的鉴定:研究特定转录因子在基因组上的结合模式。
2. 组蛋白修饰的分布:分析不同组蛋白修饰在基因组上的分布情况,这些修饰与基因的活跃或沉默有关。
3. DNA甲基化研究:结合ChIP技术可以研究DNA甲基化对基因表达的影响。
4. 染色质结构和功能:研究染色质重塑对基因表达和细胞功能的影响。
5. 疾病相关基因的调控:研究疾病状态下基因调控网络的变化。
ChIP技术是表观遗传学研究中的一个重要工具,它可以帮助科学家们理解基因表达是如何在分子水平上被精确调控的。
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免疫沉淀(immunoprecipitation)是指利用抗体可与抗原特异性结合的特性,将抗原(常为靶蛋白)从混合体系沉淀下来,初步分离靶蛋白的一种方法。免疫共沉淀(coimmunoprecipitation)是一种在体外探测两个蛋白分子间是否存在特异性相互作用的一种方法。其原理非常简单,如果两个蛋白在体外体系能够发生特异性相互作用的话,那么当用一种蛋白的抗体进行免疫沉淀时,另一个蛋白也会被同时沉淀下来。与酵母双杂交技术不同,免疫共沉淀技术所利用的是抗原和抗体间的免疫反应,是一种基于体外非细胞的环境中研究蛋白质与蛋白质的相互作用的方法。
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