免疫沉淀实验步骤:
1. 样品制备
a. 悬浮细胞样品处理:离心收集细胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把细胞用力弹散。按照6孔板每孔细胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液(裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail,使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×)。混匀后置于冰上处理10 min;离心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上备用(或置于-20℃长期保存)。
b. 贴壁细胞样品处理:移去培养基,用PBS清洗细胞两遍;用细胞刮棒刮脱细胞,收集至1.5mL EP管内,按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液(裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail,使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×)。吹打数下,使裂解液和细胞充分接触。混匀后置于冰上处理10 min;离心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上备用(或置于-20℃长期保存)。
4. 后续:磁珠预处理——抗体吸附——抗原结合反应——抗体洗脱
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免疫沉淀技术的实验设计通常包括以下几个关键步骤:
1. 目标蛋白质的选择:
2. 抗体的选择:选择特异性强、亲和力高的抗体来捕获目标蛋白质
3. 样本的准备:收集和准备细胞或组织样本。
4. 蛋白质的裂解和释放:选择合适的裂解条件,如pH值、离子强度、去污剂等。
5. 蛋白质浓度的测定:确定裂解液中蛋白质的浓度,以便于后续步骤的标准化。
6. 免疫沉淀的操作:将特异性抗体与裂解液混合,并在适宜的条件下孵育,以形成抗体-抗原复合物。
7. 非特异性结合的减少:通过预纯化步骤去除可能的非特异性结合蛋白。
8. 洗涤:多次洗涤以去除未结合的蛋白质和杂质。
9. 目标蛋白质的洗脱:使用适当的缓冲液洗脱抗体-抗原复合物。
10. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行进一步分析,如Western Blot.
11. 对照实验:设计适当的正对照和负对照,以评估实验的特异性和敏感性。
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免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)的实验步骤通常包括以下几个关键环节:
1. 细胞裂解:首先需要收集细胞并裂解它们,以释放细胞内的蛋白质。这通常通过添加含有蛋白酶抑制剂的裂解缓冲液来完成,以防止蛋白质降解。
2. 裂解物上清:裂解后的细胞混合物通常需要通过离心来去除未破碎的细胞碎片和未裂解的细胞,从而获得上清。
3. 抗体的添加:将特定于目标蛋白的抗体加入到裂解物中。这些抗体将特异性地结合到目标蛋白上。
4. 免疫复合物的形成:抗体与目标蛋白结合形成免疫复合物。
5. 免疫复合物的捕获:使用Protein A/G结合的磁珠来捕获免疫复合物。
6. 洗涤:捕获免疫复合物后,需要用裂解/洗涤缓冲液多次洗涤,以去除未结合的蛋白质和其他污染物。
7. 洗脱:免疫复合物可以通过加入SDS样品缓冲液进行洗脱,这将导致抗体和抗原变性并从珠子上释放下来,或者使用低pH缓冲液进行温和洗脱,以保持蛋白质的天然构象。
8. 分析:洗脱后的样品可以通过SDS-PAGE凝胶电泳、Western blot等方法进行分析,以验证目标蛋白的存在和状态。
免疫共沉淀分析(Co-IP)与IP十分类似,基本的技术都是采用目标抗原特异性的固相化抗体;但IP的目标是纯化单一抗原,而Co-IP旨在分离抗原及与抗原结合的蛋白质或配体。
在Co-IP实验中,已知抗原称为诱饵蛋白,与之结合的蛋白则称为靶蛋白。靶蛋白可能是一些复杂的伴侣蛋白、信号分子、结构蛋白、辅助因子等,蛋白间相互作用强度范围可能介于高度瞬时和十分稳定之间。
基本的Co-IP实验方案与IP相同,实际上任何IP系统均可用于Co-IP。但是,还有许多其他因素需要考虑,例如,结合和洗涤条件的优化,优化时,需要考虑到诱饵蛋白-靶蛋白的相互作用强度以及抗体-诱饵蛋白的亲和力。
免疫沉淀技术ChIP是什么?
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验设计概述:
1. 目标蛋白的选择:确定您想要研究的目标蛋白,例如特定的转录因子或组蛋白修饰。
2. 样本的准备:根据研究的需要选择合适的细胞或组织样本。
3. 抗体的选择:选择具有高特异性和亲和力的抗体,这对于实验的成功至关重要。
4. 交联:使用甲醛等交联剂将蛋白质与DNA在体内共价结合,形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
5. 细胞裂解:裂解细胞以释放染色质,同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
6. 染色质的剪切:通过超声或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段,通常在200-1000 bp之间。
7. 免疫沉淀:使用特定抗体与目标蛋白结合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀复合物。
8. 洗涤和洗脱:洗涤沉淀物以去除未特异性结合的蛋白质和DNA,然后洗脱目标蛋白-DNA复合物。
9. 逆转交联:使用蛋白酶K处理样品以逆转交联,释放DNA。
10. DNA的纯化和分析:纯化DNA并使用qPCR、芯片或测序技术(如ChIP-seq)进行分析。
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免疫沉淀的原理是什么?苏州RIP免疫沉淀磁珠哪个公司好用
免疫沉淀IP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
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