企业商机
整合位点基本参数
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整合位点企业商机

例如,对于经过基因修饰的免疫细胞zhiliao产品如CAR-T,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)和流式细胞术(Flowcytometry)进行PK分析,分别通过测定外源基因拷贝和CAR+细胞数量的变化,有助于互相验证检测方法的可靠性,可以更duomian的分析产品在体内的扩增和存活情况。对于大多数免疫细胞zhiliao产品,可以通过细胞和/或体液免疫应答分析药效学活性。有多个特异性靶点的zhiliao产品,应分析其对每个靶点的作用活性。如果细胞经体外基因修饰,在体内分泌特定蛋白、多肽或其它活性成分,或敲除了特定基因的表达,也需要进行针对性的药效学分析,如检测特定蛋白的活性、持续时间和变化情况等。CAR-T慢病毒整合位点检测浅析。北京AAV整合位点方法

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插入突变风险评估一些整合性载体(如逆转录病毒、慢病毒、转座子)可将外源基因插入整合到细胞基因组中,这可能会导致关键基因突变或jihuo原基因,从而导致恶性liu风险增加。影响插入突变的关键风险因素包括:(1)载体的整合特征,如插入位点的偏好性;(2)载体的设计,如增强子、启动子等构建元件的活性,影响邻近基因的潜力;产生剪接突变体的潜在剪接位点或多聚腺苷酸信号等;(3)细胞载体拷贝数;4)转基因表达产物的功能活性(如与细胞生长调控相关)和表达水平;5)靶细胞群的转化可能性,这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。常州LV整合位点技术慢病毒载体在CAR-T细胞中的整合位点分析方法及引物。

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由于免疫细胞zhiliao产品的长期存活及持久性作用,申请人应对临床试验期间接受zhiliao的所有受试者进行适当的长期随访,关注受试者生存、新发或继发aizheng、ganran、免疫功能变化及迟发性不良反应等安全性风险,以及非临床或临床数据提示需要关注的潜在风险,并观察产品在体内的持续存在时间、转基因表达时间(如有)、是否有致瘤性、免疫原性等。随访时间主要取决于免疫细胞zhiliao产品的风险水平、体内的存活和作用时间、疾病进程的认识等,应足以观察到可能由于产品特性、暴露性质等导致的受试者风险,并不应短于迟发不良事件的预期发生时间。

上述建议是基于现有科学认识,随着临床研究和应用数据的积累,以及对免疫细胞zhiliao产品了解的深入,可能会对随访时间的建议进行调整。根据临床试验的研究计划和持续时间,长期随访可能作为临床试验的一部分,或者设计为一项单独研究,如果对长期监测有一个单独的研究方案,在受试者参加临床试验前,除获得受试者对干预性临床试验的知情同意外,还应获得其对长期随访研究计划的知情同意。如果长期随访作为临床试验的一部分,随访时间可能超过主要终点或获益风险评估所需要的观察时间,这种情况下,通常无需在开始后续试验或提交上市申请之前完成长期随访。整合位点相比γ-逆转录病毒更安全但成本更高。

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如果基因组整合相关风险的分析可行,应注意以下几点:Ÿ在接受基因zhiliao产品的较初5年内,两次检测间的采样间隔建议不超过6个月。此后每年至少检测一次,直至检测数据表明不再存在任何安全性风险。检测方法的敏感度、特异性和可重复性应经过验证,并设计适当的阳性和阴性对照;当体内靶细胞或替代细胞中载体序列阳性的比例超出预期范围时,应开展克隆性生长的评估。如果存在优势克隆或单克隆生长,应在不超过3个月的时间内再次检测确认,并尽快开展整合位点的分析。Ÿ当载体的整合位点确定后,应与人类基因组数据库及基因组的其他数据库等进行比较,确定整合位点的基因功能,评估是否与包括zheng在内的任何疾病有关。如果受试者体内出现载体阳性细胞的克隆性生长,或检测发现基因整合位点在基因或相关基因附近,应缩短检测间隔至不超过3个月并密切监测恶性征兆,直至检测不到基因zhiliao载体。对基于慢病毒/逆转录病毒载体的基因zhiliao产品,如出现与可复制xingbing毒可能相关的不良事件,还应开展可复制xingbing毒(replicablecompetentlentivirus/retrovirus,RCL/RCR)的检测。慢病毒载体在CAR-T细胞中的整合位点分析方法。北京AAV整合位点方法

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病人在6个月后达到MRD阴性,CAR-T细胞在4.2年后仍然可以在外周血检测到,并且骨髓中检测不到B细胞liu克隆。二代测序整合位点分析显示这是因为某些CAR-T细胞的融合位置位于TET2基因9号到10号外显子之间可变剪切区域,导致TET2基因跳读和功能障碍,从而产生短寿命记忆细胞扩增和长寿命记忆细胞。使得药物可以持久作用于病人。研究者继而进行插入位点和CAR-T细胞扩增及持续作用时间的相关研究,利用慢病毒插入位点信息(INSPIIRED)和LASSO logistic 回归模型进行插入位置和药效学分析,初步建立预测模型。研究者还建议在CAR-T产品回输前进行类似的多变量预测可以对产品的安全性和有效性进行更为有效的评估。北京AAV整合位点方法

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