蛋白酶用于生成肽，用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影，传统的蛋白酶并不总是理想的，因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶，可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比，所得肽更长，并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物，使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性，即使在长时间孵育过夜后，酶与底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性，但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1：20 和过夜孵育下，证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下，GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性，并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。Genovis的FabDELLO酶在底物（包括LALA和LFLE突变的IgG1)上的有效性。四川FabALACTICAIdeS蛋白酶
抗体由于其大小和复杂性，是一种难以表征的分子。偶联药物有效载荷是对抗Ai症等疾病的一种有吸引力的方法，但进一步增加了异质性的复杂性和风险。抗体药物偶联物 （ADC） 需要像任何其他基于 IgG 的生物制药一样进行仔细和详细的表征，并且需要适当的分析工作流程。Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶将ADC消化成其亚基，可以详细表征这类复杂的药物。Genovis的内切糖苷酶 IgGZERO和 GlycINATOR 还可以研究完整的 ADC，但降低复杂性并提高分辨率。江苏FabDELLOIdeS蛋白酶可使用FabULOUS 和 FabULOUS Fab 试剂盒可用于制备 Fab 片段。
LC-MS中级分析是一种被大众接受的分析方法，用于快速表征mAb和其他基于IgG的生物制药。它有助于理解多种关键质量属性 （CQA），例如糖基化、氧化和 C 端赖氨酸剪切。这种关于翻译后修饰（PTM）的详细知识是生物制药开发和制造所必需的。Genovis的FabRICATOR HPLC酶色谱柱，可快速进行单克隆抗体的柱上酶切，并产生一致的亚基。该色谱柱含有固定化的FabRICATOR（IdeS）酶，可在铰链下方快速且特异性地消化IgG，产生F（ab'）2和Fc片段，而不会出现任何过度消化的风险。为了减少样品处理并为样品制备提供自动化解决方案，FabRICATOR被共价固定在树脂上，并装在适用于HPLC的PEEK色谱柱硬件中。使用FabRICATOR HPLC色谱柱，只需稍作修改，即可使用标准HPLC-MS装置自动生成抗体亚基。然后，FabRICATOR HPLC色谱柱上消解产生的亚基被捕获在在线连接的反相（RP）色谱柱的柱头上。
与IdeS不同，Romiplostim 由四个相同的血小板生成素 （TPO） 受体结合肽和一个 Fc 片段组成，通过柔性聚甘氨酸序列连接在一起。与度拉糖肽类似，用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下过夜，或用 GlySERIAS 冻干 1 小时并在 37°C 下过夜消化该蛋白质。 链间二硫键被还原，以便于通过反相LC-MS进行以下分析。与度拉糖肽的观察结果类似，用固定化酶消化产生均质的 Fc/2，剩下一个连接子残基，此处为甘氨酸残基。这有助于识别专门位于Fc区域的修改。用冻干酶消化 1 小时得到 Fc/2，剩余 4 个甘氨酸残基和少量的 Fc/2 仍与一个 TPO 肽连接。另一方面，这使得研究 Fc/2 和第yi个肽之间的连接区域成为可能，而不会受到第二个肽的干扰。用 GlySERIAS 冻干液过夜消化产生 2 个 Fc/2 变体，分别剩下 4 个和 1 个甘氨酸残基。根据消化时间的不同，使用冻干产物释放的肽以五或七种变体存在，接头中残留的甘氨酸残基数量不同，而使用固定化产物释放的肽以四种变体存在。GingisKHAN用于LC-MS表征基于抗体的生物药研究。
与IdeS不同，在蛋白质zhiliao药物的质量控制过程中，详细分析和识别质量属性非常重要。对于具有柔性连接子的融合蛋白疗法，这包括确认连接蛋白的质量以及蛋白质接头的质量。使用 Genovis的GlySERIAS 的连接子酶切可以通过分离连接的蛋白质结构域来帮助这种质量控制。然而，连接子中的大量甘氨酸残基提供了酶的许多潜在消化位点，导致连接子内多个位点同时水解。消化的产物通常由连接蛋白的几种变体组成，并保留不同程度的连接子。虽然观察到的异质性通常不会对蛋白质亚基的详细表征产生负面影响，但有助于直接表征连接子，但有时需要更均匀的消化产物来详细分析单个蛋白质结构域。GlySERIAS酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域，以促进表征并增加对这些分子的理解。黑龙江FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
并通过反相LC-MS进行分析，消化产生均匀的Fab和Fc片段。四川FabALACTICAIdeS蛋白酶
Genovis的FabDELLO在铰链上方的单个位点消化人IgG1，并在两小时内生成均质的Fab和Fc片段（Genovis的IdeS在铰链区下方的单个位点进行消化）。生成的片段可用于结晶和高阶结构（HOS）的NMR研究、结合研究等。突变的铰链区域是zhiliao性候选抗体的常见修饰，以降低效应器功能。这些突变可能会影响具有高底物特异性的酶的抗体消化效率。例如，高度特异性的FabRICATOR（IdeS）消化效率对含有常见LALA突变的抗体产生负面影响。FabDELLO作用于人IgG1铰链上方的单个暴露赖氨酸残基，能够对具有突变铰链区域的抗体进行流行的中级LC-MS分析。例如，用FabDELLO消化市售的IgG1risankizumab，在下铰链区域具有LALA突变，并通过反相LC-MS进行分析。消化产生均匀的Fab和Fc片段。用20mMDTT还原片段，用于中级LC-MS分析，发现产生了均相的Fc/2、轻链（LC）和Fd片段。用FabDELLO消化后观察到的定义峰显示出均匀的片段生成和酶的稳健性能。四川FabALACTICAIdeS蛋白酶
大多数商业zhiliao性抗体属于IgG类，在Fc结构域中含有N-聚糖。一个重要的关键质量属性是糖基...
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