免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能检测不到低亲和力和瞬间的相互作用：低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质之间的相互作用可能检测不到，这可能导致某些重要的相互作用被遗漏。不能确保直接相互作用：免疫共沉淀不能保证沉淀的蛋白复合物是由直接相互作用的两种蛋白组成。两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用。灵敏度限制：免疫共沉淀的灵敏度不如某些其他技术，如亲和色谱，这可能影响到对低丰度蛋白或微弱相互作用的研究。样本纯度要求高：如果将蛋白复合物直接进行质谱分析，需要得到较高纯度和浓度的蛋白复合物样品，这并非易事，并且成本较高。对抗体要求高：用于免疫共沉淀的抗体不是总是与操作相合适，与Western blotting或者 ELISA相比容易出现假阳性反应。Co-IP内源检测验证蛋白互作，结果可靠需严控条件，抗体特异、洗涤充分是关键！四川CoIP联合质谱
Co-IP实验的内源检测注意事项如下：首先，确保使用的抗体具有高特异性和亲和力，这是内源检测成功的关键。由于细胞内蛋白表达复杂，非特异性结合可能导致实验结果失真。其次，严格控制实验条件，如细胞裂解和洗涤条件，以避免破坏蛋白质相互作用或引入非特异性蛋白。温和地释放细胞内蛋白，保证释放出的蛋白不被蛋白酶分解，同时实验过程需保持低温。此外，注意样本的采集和处理。样本应尽快处理，避免蛋白降解，同时防止样本在运输过程中温度过高导致变质。另外，结合其他实验方法进行验证，如Western Blot等，以确认Co-IP实验结果的可靠性。综上所述，Co-IP实验的内源检测需要关注抗体选择、实验条件控制、样本处理以及结果验证等方面，以确保实验结果的准确性和可靠性。中国香港蛋白蛋白互作检测CoIP质谱IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）技术应用场景。
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是一种基于抗原与抗体特异性结合用于研究蛋白质与蛋白质相互作用的方法。常用于候选目标蛋白质之间是否有相互作用，也用于确定与已知蛋白质互作的其它未知蛋白质相互作用。基本原理：当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质－蛋白质间的相互作用被保留了下来。免疫共沉淀实验流程：蛋白质样本收集-A抗体沉淀目的蛋白A-SDS-PAGE分离-WB检测B蛋白或者质谱鉴定互作蛋白。Co-IP的优点主要包括高特异性、灵敏度高、与质谱技术兼容、操作相对简便。
Co-IP技术作为研究蛋白质相互作用的重要手段，其结果在多数情况下是可靠的。然而，该技术也存在一些潜在的限制和影响因素，需要研究人员予以注意。在实际应用中，由于细胞内蛋白质种类繁多且相互作用复杂，可能会出现非特异性结合或背景噪声，这要求研究者选择特异性强的抗体，并通过洗涤步骤去除杂质。此外，样品的纯度、抗体的质量和实验条件等也会对结果产生影响，因此，对抗体的选择和验证、样品的准备以及实验条件的控制都至关重要。为了进一步提高结果的准确性，研究人员通常会结合多种方法进行相互验证，如使用不同抗体或实验条件重复实验，或结合质谱技术来验证Co-IP的结果。这些措施共同增强了Co-IP技术结果的可靠性。免疫共沉淀强大但局限，需谨慎分析数据，避免冒险性。
在CoIP（免疫共沉淀）实验中，对照组的设计对实验结果尤为重要，阳性对照组设计建议如下：1. 已知相互作用蛋白对照组：如果可能的话，使用已知与诱饵蛋白相互作用的蛋白作为阳性对照。这可以验证实验条件的可行性，以及抗体和实验方法的可靠性。2. 设置过量诱饵蛋白对照组：通过加入过量的诱饵蛋白，可以验证靶蛋白与诱饵蛋白之间的相互作用是否具有饱和性。如果加入过量诱饵蛋白后，靶蛋白的结合减少或消失，则表明相互作用具有饱和性。IP-Mass（免疫沉淀-质谱）技术应用场景。广西相互作用蛋白检测CoIP Western Blot检测
Co-IP（免疫共沉淀）技术应用场景。四川CoIP联合质谱
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一种经典的用于研究蛋白质相互作用的方法，它基于抗体和抗原之间的专一性作用。该技术主要用于确定两种蛋白质在完整细胞内的生理性相互作用。基本原理：当细胞在非变性条件下被裂解时，细胞内蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留下来。通过利用预先固化在agarose beads上的蛋白质A的抗体来免疫沉淀A蛋白，与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。随后，通过蛋白变性分离，可以对B蛋白进行检测，从而证明两者之间的相互作用。四川CoIP联合质谱
