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医学实验外包,circRNA Pulldown(环状RNA)介绍:使用生物素RNA探针,与细胞裂解液孵育,形成探针-circRNA-蛋白质复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合,从而与裂解液中的其他成分分离。磁珠复合物洗脱后,可通过western blot实验或质谱实验检测特定的circRNA结合蛋白是否与circRNA相互作用。RNA pull-down实验就是先将RNA进行标记(如生物素探针标记),再与细胞裂解液共同孵育,从而形成RNA-蛋白质复合物,之后再分离复合物得到蛋白质,通过western blot 或mass Spectrometry检测蛋白质的技术。目前RNA pull-down技术已成为研究miRNA、lncRNA与相互作用蛋白的主要技术手段之一。

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