AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项研究,对类风湿关节炎(RA)患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析,鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能,并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联,提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎(RA)患者及42名健康对照,对肠道菌群进行全基因组深度测序;②RA患者的肠道菌群宏基因组中,普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人;③RA患者的肠道菌群宏基因组中,R6FCZ7(与氧化还原反应相关的基因)的丰度明显低于健康人,而代谢相关通路(脂肪酸生物合成、粘多糖降解等)明显富集;④通过对比宏基因组关联分析(MWAS)与全基因组关联分析(GWAS),鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。肠道菌群检测有重大意义;安徽粪便菌群检测预测疾病
肠道菌群失调与自身免疫疾病的发展相关。Nature Communications上发表的一项新研究,发现类风湿关节炎(RA)的发生与肠道屏障功能的受损密切相关,新发病RA患者的血清连蛋白表达增加,而肠道紧密连接蛋白表达降低。在关节炎小鼠模型中,肠道炎症发生早于关节炎的发病,而靶向肠道屏障或连蛋白可起到缓解关节炎的作用。该研究提示,靶向肠道屏障或是改善类风湿关节炎等自身免疫疾病的潜在策略。①对比40名RA患者、41名健康对照、19名cancer患者及21名丙肝患者,发现RA患者的血清连蛋白水平明显升高;②纵向研究结果显示,血清连蛋白水平较高者在1年内发生RA的风险更高;③RA患者(包括新发病患者)肠道上皮细胞中的紧密连接蛋白(包括occludin与claudin-1)表达明显降低;④在胶原诱导的关节炎(CIA)小鼠模型中,肠道炎症及T细胞在肠道中的累积发生于关节炎发病之前;⑤丁酸盐处理降低肠道通透性,或使用药物靶向抑制连蛋白可缓解CIA。江苏肠道菌群检测风险预测肠道菌群检测:对抗腹泻新武器!
来自北京协和医院的张烜团队与华大基因的揭著业团队在JournalofAutoimmunity上发表的一项研究,① 对比分析85名强直性脊柱炎(AS)患者及62名健康人的肠道菌群,发现惰性真杆菌等5种菌种在AS患者中富集;② 在AS患者的肠道菌群中,氧化磷酸化、脂多糖生物合成和粘多糖降解作用增强;③ AS患者中存在脆弱拟杆菌和III型分泌系统等与自身免疫相关的特征;④ AS患者肠道菌群中部分富集的细菌多肽可模拟II型胶原,并促进特定HLA分类(HLA-B27)AS患者的PBMC产生IFN-γ。
从功能上讲,痛风患者的果糖、甘露糖代谢和脂质A生物合成基因丰度较高,尿酸降解和短链脂肪酸生成基因丰度较低。结合临床数据分析得到肠杆菌科物种丰度的降低与氨基酸代谢和环境感知的降低有关,这两者共同导致痛风患者血清尿酸和C反应蛋白水平升高。基于三个肠道微生物基因的随机森林分类器在发现和验证队列中对痛风病症具有较高的预测性(准确度为0.91和0.80)。纵向分析表明,24周后,降尿酸恢复了部分肠道微生物群。与肥胖、2型糖尿病(T2D)、强直性脊柱炎(AS)和类风湿性关节炎(RA)的对比分析表明,与代谢性疾病相比,痛风的宏基因组跟自身免疫性疾病的相似度更高。该研究揭示了肠道生态失调与宿主尿酸盐降解和全身炎症的失调有关,可作为痛风的非侵入性诊断标志物。专业肠道菌群检测请到上海沃本;
自从引入了细菌的基因组学分析以来,针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法,常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异,因为这种差异通常很小。相反地,宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组,这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。肠道菌群检测:对抗代谢性疾病新武器!安徽肠道菌群检测准确性高
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AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对比了强直性脊柱炎患者与健康人的粪便菌群组成差异,并发现患者粪便中潜在的交叉反应性细菌表位的富集,同时,抗TNF改善与患者菌群的恢复、交叉性细菌表位的减少相关。①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。安徽粪便菌群检测预测疾病
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